RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450602.6

CXorf40A-211, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 3 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-211ENST00000450602 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.06■■■■□ 3.52
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CXorf40A-211ENST00000450602 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.32■■■□□ 2.6
CXorf40A-211ENST00000450602 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.02■■■□□ 2.56
CXorf40A-211ENST00000450602 NACADO15069 1562 aa30.96■■■□□ 2.55
CXorf40A-211ENST00000450602 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CXorf40A-211ENST00000450602 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.7■■■□□ 2.51
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CXorf40A-211ENST00000450602 SCRIBQ14160 1630 aa30.1■■■□□ 2.41
CXorf40A-211ENST00000450602 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.96■■■□□ 2.39
CXorf40A-211ENST00000450602 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.67■■■□□ 2.34
CXorf40A-211ENST00000450602 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.6■■■□□ 2.33
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CXorf40A-211ENST00000450602 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.13■■■□□ 2.25
CXorf40A-211ENST00000450602 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.01■■■□□ 2.23
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CXorf40A-211ENST00000450602 SMARCA4P51532 1647 aa28.72■■■□□ 2.19
CXorf40A-211ENST00000450602 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.6■■■□□ 2.17
CXorf40A-211ENST00000450602 SMARCA2P51531 1590 aa28.58■■■□□ 2.17
CXorf40A-211ENST00000450602 NCAPD3P42695 1498 aa28.57■■■□□ 2.16
CXorf40A-211ENST00000450602 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.57■■■□□ 2.16
CXorf40A-211ENST00000450602 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CXorf40A-211ENST00000450602 HMGXB3Q12766 1538 aa28.38■■■□□ 2.13
CXorf40A-211ENST00000450602 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.37■■■□□ 2.13
CXorf40A-211ENST00000450602 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CXorf40A-211ENST00000450602 WIZO95785 1651 aa28.26■■■□□ 2.12
CXorf40A-211ENST00000450602 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CXorf40A-211ENST00000450602 ERCC6Q03468 1493 aa27.91■■■□□ 2.06
CXorf40A-211ENST00000450602 NESP48681 1621 aa27.91■■■□□ 2.06
CXorf40A-211ENST00000450602 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CXorf40A-211ENST00000450602 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.81■■■□□ 2.04
CXorf40A-211ENST00000450602 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.81■■■□□ 2.04
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CXorf40A-211ENST00000450602 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.68■■■□□ 2.02
CXorf40A-211ENST00000450602 CFTRP13569 1480 aa27.58■■■□□ 2.01
CXorf40A-211ENST00000450602 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.5■■□□□ 1.99
CXorf40A-211ENST00000450602 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.48■■□□□ 1.99
CXorf40A-211ENST00000450602 CUX2O14529 1486 aa27.47■■□□□ 1.99
CXorf40A-211ENST00000450602 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.45■■□□□ 1.99
CXorf40A-211ENST00000450602 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.38■■□□□ 1.97
CXorf40A-211ENST00000450602 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CXorf40A-211ENST00000450602 PRDM2Q13029 1718 aa27.27■■□□□ 1.96
CXorf40A-211ENST00000450602 WDR62O43379 1518 aa27.21■■□□□ 1.95
CXorf40A-211ENST00000450602 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCC8Q09428 1581 aa27.05■■□□□ 1.92
CXorf40A-211ENST00000450602 TOPBP1Q92547 1522 aa27.01■■□□□ 1.91
CXorf40A-211ENST00000450602 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.96■■□□□ 1.91
CXorf40A-211ENST00000450602 IFT140Q96RY7 1462 aa26.87■■□□□ 1.89
CXorf40A-211ENST00000450602 CUX1P39880 1505 aa26.79■■□□□ 1.88
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CXorf40A-211ENST00000450602 SOGA1O94964 1423 aa26.77■■□□□ 1.88
CXorf40A-211ENST00000450602 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.74■■□□□ 1.87
CXorf40A-211ENST00000450602 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
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CXorf40A-211ENST00000450602 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.71■■□□□ 1.87
CXorf40A-211ENST00000450602 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.69■■□□□ 1.86
CXorf40A-211ENST00000450602 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
CXorf40A-211ENST00000450602 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
CXorf40A-211ENST00000450602 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CXorf40A-211ENST00000450602 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CXorf40A-211ENST00000450602 TOP2BQ02880 1626 aa26.56■■□□□ 1.84
CXorf40A-211ENST00000450602 SYNJ1O43426 1573 aa26.55■■□□□ 1.84
CXorf40A-211ENST00000450602 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.51■■□□□ 1.83
CXorf40A-211ENST00000450602 OSCARQ8IYS5 282 aa26.51■■□□□ 1.83
CXorf40A-211ENST00000450602 FBLN2P98095 1184 aa26.5■■□□□ 1.83
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.45■■□□□ 1.83
CXorf40A-211ENST00000450602 WDR97A6NE52 1622 aa26.43■■□□□ 1.82
CXorf40A-211ENST00000450602 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.42■■□□□ 1.82
CXorf40A-211ENST00000450602 GRIN2BQ13224 1484 aa26.4■■□□□ 1.82
CXorf40A-211ENST00000450602 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CXorf40A-211ENST00000450602 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.36■■□□□ 1.81
CXorf40A-211ENST00000450602 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CXorf40A-211ENST00000450602 TRIM41Q8WV44 630 aa26.28■■□□□ 1.8
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.28■■□□□ 1.8
CXorf40A-211ENST00000450602 PBRM1Q86U86 1689 aa26.25■■□□□ 1.79
CXorf40A-211ENST00000450602 CHD1O14646 1710 aa26.22■■□□□ 1.79
CXorf40A-211ENST00000450602 SYNJ2O15056 1496 aa26.21■■□□□ 1.79
CXorf40A-211ENST00000450602 KIF27Q86VH2 1401 aa26.19■■□□□ 1.78
CXorf40A-211ENST00000450602 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.14■■□□□ 1.77
CXorf40A-211ENST00000450602 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.11■■□□□ 1.77
CXorf40A-211ENST00000450602 ADAMTS12P58397 1594 aa26.05■■□□□ 1.76
CXorf40A-211ENST00000450602 IGF1RP08069 1367 aa26.04■■□□□ 1.76
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CXorf40A-211ENST00000450602 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.91■■□□□ 1.74
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CXorf40A-211ENST00000450602 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.89■■□□□ 1.74
CXorf40A-211ENST00000450602 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.89■■□□□ 1.74
CXorf40A-211ENST00000450602 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.89■■□□□ 1.74
CXorf40A-211ENST00000450602 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.89■■□□□ 1.74
CXorf40A-211ENST00000450602 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.88■■□□□ 1.73
CXorf40A-211ENST00000450602 NUP160Q12769 1436 aa25.88■■□□□ 1.73
CXorf40A-211ENST00000450602 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.87■■□□□ 1.73
CXorf40A-211ENST00000450602 CEP170Q5SW79 1584 aa25.86■■□□□ 1.73
CXorf40A-211ENST00000450602 JPH4Q96JJ6 628 aa25.78■■□□□ 1.72
CXorf40A-211ENST00000450602 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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