RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.33■■■■□ 3.73
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NACADO15069 1562 aa32.2■■■□□ 2.75
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.91■■■□□ 2.7
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.6■■■□□ 2.65
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCRIBQ14160 1630 aa31.2■■■□□ 2.59
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.98■■■□□ 2.55
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.5■■■□□ 2.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.33■■■□□ 2.45
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.7■■■□□ 2.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMARCA2P51531 1590 aa29.65■■■□□ 2.34
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.51■■■□□ 2.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WIZO95785 1651 aa29.22■■■□□ 2.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NESP48681 1621 aa29.12■■■□□ 2.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERCC6Q03468 1493 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.98■■■□□ 2.23
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CUX2O14529 1486 aa28.87■■■□□ 2.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.84■■■□□ 2.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.78■■■□□ 2.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.77■■■□□ 2.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CFTRP13569 1480 aa28.62■■■□□ 2.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.54■■■□□ 2.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.53■■■□□ 2.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.52■■■□□ 2.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.52■■■□□ 2.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR62O43379 1518 aa28.45■■■□□ 2.15
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRDM2Q13029 1718 aa28.38■■■□□ 2.13
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFT140Q96RY7 1462 aa27.92■■■□□ 2.06
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SOGA1O94964 1423 aa27.65■■■□□ 2.02
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHD1O14646 1710 aa27.42■■□□□ 1.98
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.33■■□□□ 1.97
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.32■■□□□ 1.96
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PBRM1Q86U86 1689 aa27.31■■□□□ 1.96
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM41Q8WV44 630 aa27.27■■□□□ 1.96
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.23■■□□□ 1.95
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.23■■□□□ 1.95
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.23■■□□□ 1.95
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYNJ2O15056 1496 aa27.22■■□□□ 1.95
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGEF11O15085 1522 aa27.2■■□□□ 1.94
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.11■■□□□ 1.93
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAMTS12P58397 1594 aa27.09■■□□□ 1.93
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRIN2AQ12879 1464 aa27.02■■□□□ 1.92
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27■■□□□ 1.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARAP1Q96P48 1450 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEP170Q5SW79 1584 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUP160Q12769 1436 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF27Q86VH2 1401 aa26.89■■□□□ 1.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGF1RP08069 1367 aa26.81■■□□□ 1.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CUL7Q14999 1698 aa26.76■■□□□ 1.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SHROOM2Q13796 1616 aa26.74■■□□□ 1.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.74■■□□□ 1.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.7■■□□□ 1.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.65■■□□□ 1.86
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