RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

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Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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SOGA3-201ENST00000465909 HRCP23327 699 aa24.8■■□□□ 1.56
SOGA3-201ENST00000465909 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SOGA3-201ENST00000465909 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.68■■□□□ 1.54
SOGA3-201ENST00000465909 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SOGA3-201ENST00000465909 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.23■■□□□ 1.47
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SOGA3-201ENST00000465909 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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SOGA3-201ENST00000465909 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.45■■□□□ 1.35
SOGA3-201ENST00000465909 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.43■■□□□ 1.34
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SOGA3-201ENST00000465909 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.32■■□□□ 1.32
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SOGA3-201ENST00000465909 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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SOGA3-201ENST00000465909 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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SOGA3-201ENST00000465909 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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SOGA3-201ENST00000465909 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.18■■□□□ 1.14
SOGA3-201ENST00000465909 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.18■■□□□ 1.14
SOGA3-201ENST00000465909 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.11■■□□□ 1.13
SOGA3-201ENST00000465909 MIER1Q8N108 512 aa22.1■■□□□ 1.13
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SOGA3-201ENST00000465909 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.78■■□□□ 1.08
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SOGA3-201ENST00000465909 NBR1Q14596 966 aa21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-201ENST00000465909 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SOGA3-201ENST00000465909 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SOGA3-201ENST00000465909 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.35■■□□□ 1.01
SOGA3-201ENST00000465909 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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SOGA3-201ENST00000465909 TRIM52Q96A61 297 aa21.27■■□□□ 1
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SOGA3-201ENST00000465909 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.29■□□□□ 0.84
SOGA3-201ENST00000465909 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.29■□□□□ 0.84
SOGA3-201ENST00000465909 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.29■□□□□ 0.84
SOGA3-201ENST00000465909 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.28■□□□□ 0.84
SOGA3-201ENST00000465909 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SOGA3-201ENST00000465909 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SOGA3-201ENST00000465909 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.23■□□□□ 0.83
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