Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 MTG2-202ENST00000448254 727 ntTSL 513.19□□□□□ -0.38e-12■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MTG2-205ENST00000466933 667 ntTSL 311.97□□□□□ -0.498e-12■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-19■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-19■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.077e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-215ENST00000510101 704 ntTSL 324.02■■□□□ 1.445e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-213ENST00000508684 3059 ntTSL 222.06■■□□□ 1.125e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.345e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.335e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 214.08□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 CLUH-208ENST00000574166 585 ntTSL 413.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 DEK-203ENST00000503715 580 ntTSL 512.67□□□□□ -0.389e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.525e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-214ENST00000509039 1569 ntTSL 210.18□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-216ENST00000511797 671 ntTSL 59.82□□□□□ -0.845e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-212ENST00000508277 491 ntTSL 59.35□□□□□ -0.915e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-224ENST00000539108 244 ntTSL 36.98□□□□□ -1.295e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ADD1-226ENST00000540541 546 ntTSL 26.1□□□□□ -1.435e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.856e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.346e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.446e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.456e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.466e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.532e-12■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-12■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-12■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.12e-12■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.273e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-215ENST00000567657 780 ntTSL 317.9■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-222ENST00000569390 346 ntTSL 317.88■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-210ENST00000566313 559 ntTSL 416.62■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-216ENST00000567681 605 ntTSL 315.98■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-218ENST00000568059 572 ntTSL 415.37■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-208ENST00000565051 833 ntTSL 515.23■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-219ENST00000568519 771 ntTSL 313.55□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-211ENST00000566752 584 ntTSL 413.54□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-220ENST00000568881 587 ntTSL 313.15□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-207ENST00000564951 939 ntTSL 212.88□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-217ENST00000567959 801 ntTSL 312.64□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-204ENST00000564500 583 ntTSL 212.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-202ENST00000561643 3271 ntTSL 511.49□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 COMT-210ENST00000467943 546 ntTSL 223.05■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-208ENST00000493177 813 ntTSL 313.04□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 MSH6-211ENST00000606499 833 ntTSL 37.44□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 GYS1-203ENST00000457974 718 ntTSL 315.43■□□□□ 0.069e-10■■■■■ 27.4
PRPF4O43172 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.97e-9■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.037e-9■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.057e-9■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 ZFAND5-201ENST00000237937 5310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 P2RY11-202ENST00000471843 554 ntTSL 414.76□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 TRIM25-207ENST00000573108 952 ntTSL 311.41□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 325.09■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 223.53■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-215ENST00000495535 672 ntTSL 322.4■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 222.4■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 519.32■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 519.11■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 183.2 ms