Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms