RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322175.7

TPRX1-201, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRX1, Length 1,924 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1-201ENST00000322175 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.64■■■■□ 3.46
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.32■■■□□ 2.76
TPRX1-201ENST00000322175 ABCC9O60706 1549 aa31.58■■■□□ 2.65
TPRX1-201ENST00000322175 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.75■■■□□ 2.51
TPRX1-201ENST00000322175 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
TPRX1-201ENST00000322175 NACADO15069 1562 aa30.37■■■□□ 2.45
TPRX1-201ENST00000322175 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.36■■■□□ 2.45
TPRX1-201ENST00000322175 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.23■■■□□ 2.43
TPRX1-201ENST00000322175 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.22■■■□□ 2.43
TPRX1-201ENST00000322175 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.71■■■□□ 2.35
TPRX1-201ENST00000322175 SCRIBQ14160 1630 aa29.68■■■□□ 2.34
TPRX1-201ENST00000322175 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
TPRX1-201ENST00000322175 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.48■■■□□ 2.31
TPRX1-201ENST00000322175 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.31■■■□□ 2.28
TPRX1-201ENST00000322175 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.84■■■□□ 2.21
TPRX1-201ENST00000322175 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
TPRX1-201ENST00000322175 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.6■■■□□ 2.17
TPRX1-201ENST00000322175 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.51■■■□□ 2.16
TPRX1-201ENST00000322175 SMARCA4P51532 1647 aa28.35■■■□□ 2.13
TPRX1-201ENST00000322175 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TPRX1-201ENST00000322175 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.29■■■□□ 2.12
TPRX1-201ENST00000322175 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.16■■■□□ 2.1
TPRX1-201ENST00000322175 NCAPD3P42695 1498 aa28.08■■■□□ 2.09
TPRX1-201ENST00000322175 SMARCA2P51531 1590 aa28.07■■■□□ 2.08
TPRX1-201ENST00000322175 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TPRX1-201ENST00000322175 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.01■■■□□ 2.07
TPRX1-201ENST00000322175 WIZO95785 1651 aa28.01■■■□□ 2.07
TPRX1-201ENST00000322175 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TPRX1-201ENST00000322175 HMGXB3Q12766 1538 aa27.9■■■□□ 2.06
TPRX1-201ENST00000322175 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
TPRX1-201ENST00000322175 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
TPRX1-201ENST00000322175 NESP48681 1621 aa27.43■■□□□ 1.98
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.41■■□□□ 1.98
TPRX1-201ENST00000322175 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.32■■□□□ 1.96
TPRX1-201ENST00000322175 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.25■■□□□ 1.95
TPRX1-201ENST00000322175 CFTRP13569 1480 aa27.18■■□□□ 1.94
TPRX1-201ENST00000322175 ERCC6Q03468 1493 aa27.16■■□□□ 1.94
TPRX1-201ENST00000322175 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.11■■□□□ 1.93
TPRX1-201ENST00000322175 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.02■■□□□ 1.92
TPRX1-201ENST00000322175 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.99■■□□□ 1.91
TPRX1-201ENST00000322175 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.91■■□□□ 1.9
TPRX1-201ENST00000322175 PRDM2Q13029 1718 aa26.89■■□□□ 1.89
TPRX1-201ENST00000322175 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TPRX1-201ENST00000322175 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.8■■□□□ 1.88
TPRX1-201ENST00000322175 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
TPRX1-201ENST00000322175 WDR62O43379 1518 aa26.68■■□□□ 1.86
TPRX1-201ENST00000322175 CUX2O14529 1486 aa26.67■■□□□ 1.86
TPRX1-201ENST00000322175 TOPBP1Q92547 1522 aa26.59■■□□□ 1.85
TPRX1-201ENST00000322175 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.53■■□□□ 1.84
TPRX1-201ENST00000322175 ABCC8Q09428 1581 aa26.52■■□□□ 1.84
TPRX1-201ENST00000322175 CUX1P39880 1505 aa26.51■■□□□ 1.83
TPRX1-201ENST00000322175 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
TPRX1-201ENST00000322175 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
TPRX1-201ENST00000322175 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.37■■□□□ 1.81
TPRX1-201ENST00000322175 SYNJ1O43426 1573 aa26.36■■□□□ 1.81
TPRX1-201ENST00000322175 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.34■■□□□ 1.81
TPRX1-201ENST00000322175 SOGA1O94964 1423 aa26.32■■□□□ 1.8
TPRX1-201ENST00000322175 IFT140Q96RY7 1462 aa26.31■■□□□ 1.8
TPRX1-201ENST00000322175 TOP2BQ02880 1626 aa26.3■■□□□ 1.8
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TPRX1-201ENST00000322175 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.27■■□□□ 1.8
TPRX1-201ENST00000322175 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.26■■□□□ 1.79
TPRX1-201ENST00000322175 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TPRX1-201ENST00000322175 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TPRX1-201ENST00000322175 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
TPRX1-201ENST00000322175 TRIM41Q8WV44 630 aa26.12■■□□□ 1.77
TPRX1-201ENST00000322175 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TPRX1-201ENST00000322175 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.09■■□□□ 1.77
TPRX1-201ENST00000322175 WDR97A6NE52 1622 aa26.05■■□□□ 1.76
TPRX1-201ENST00000322175 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.99■■□□□ 1.75
TPRX1-201ENST00000322175 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.94■■□□□ 1.74
TPRX1-201ENST00000322175 GRIN2BQ13224 1484 aa25.92■■□□□ 1.74
TPRX1-201ENST00000322175 FBLN2P98095 1184 aa25.89■■□□□ 1.74
TPRX1-201ENST00000322175 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.88■■□□□ 1.73
TPRX1-201ENST00000322175 PBRM1Q86U86 1689 aa25.86■■□□□ 1.73
TPRX1-201ENST00000322175 KIF27Q86VH2 1401 aa25.85■■□□□ 1.73
TPRX1-201ENST00000322175 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.82■■□□□ 1.72
TPRX1-201ENST00000322175 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
TPRX1-201ENST00000322175 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
TPRX1-201ENST00000322175 IGF1RP08069 1367 aa25.77■■□□□ 1.72
TPRX1-201ENST00000322175 OSCARQ8IYS5 282 aa25.76■■□□□ 1.72
TPRX1-201ENST00000322175 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.76■■□□□ 1.71
TPRX1-201ENST00000322175 SYNJ2O15056 1496 aa25.72■■□□□ 1.71
TPRX1-201ENST00000322175 CHD1O14646 1710 aa25.72■■□□□ 1.71
TPRX1-201ENST00000322175 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.68■■□□□ 1.7
TPRX1-201ENST00000322175 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.67■■□□□ 1.7
TPRX1-201ENST00000322175 ADAMTS12P58397 1594 aa25.67■■□□□ 1.7
TPRX1-201ENST00000322175 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TPRX1-201ENST00000322175 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.62■■□□□ 1.69
TPRX1-201ENST00000322175 GRIN2AQ12879 1464 aa25.59■■□□□ 1.69
TPRX1-201ENST00000322175 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.55■■□□□ 1.68
TPRX1-201ENST00000322175 CUL7Q14999 1698 aa25.55■■□□□ 1.68
TPRX1-201ENST00000322175 EEA1Q15075 1411 aa25.47■■□□□ 1.67
TPRX1-201ENST00000322175 CEP170Q5SW79 1584 aa25.47■■□□□ 1.67
TPRX1-201ENST00000322175 NUP160Q12769 1436 aa25.45■■□□□ 1.67
TPRX1-201ENST00000322175 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.45■■□□□ 1.66
TPRX1-201ENST00000322175 PRXQ9BXM0 1461 aa25.43■■□□□ 1.66
TPRX1-201ENST00000322175 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.42■■□□□ 1.66
TPRX1-201ENST00000322175 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.39■■□□□ 1.66
TPRX1-201ENST00000322175 JPH4Q96JJ6 628 aa25.31■■□□□ 1.64
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