RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588742.5

ZNF226-211, Transcript of zinc finger protein 226, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF226, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF226-211ENST00000588742 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.89■■■■□ 3.82
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ZNF226-211ENST00000588742 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33■■■□□ 2.87
ZNF226-211ENST00000588742 NACADO15069 1562 aa32.83■■■□□ 2.85
ZNF226-211ENST00000588742 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.72■■■□□ 2.83
ZNF226-211ENST00000588742 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.44■■■□□ 2.78
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ZNF226-211ENST00000588742 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.24■■■□□ 2.75
ZNF226-211ENST00000588742 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.16■■■□□ 2.74
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ZNF226-211ENST00000588742 SCRIBQ14160 1630 aa31.78■■■□□ 2.68
ZNF226-211ENST00000588742 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.76■■■□□ 2.67
ZNF226-211ENST00000588742 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.63■■■□□ 2.65
ZNF226-211ENST00000588742 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
ZNF226-211ENST00000588742 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.13■■■□□ 2.57
ZNF226-211ENST00000588742 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.98■■■□□ 2.55
ZNF226-211ENST00000588742 SMARCA4P51532 1647 aa30.33■■■□□ 2.45
ZNF226-211ENST00000588742 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
ZNF226-211ENST00000588742 SMARCA2P51531 1590 aa30.23■■■□□ 2.43
ZNF226-211ENST00000588742 NCAPD3P42695 1498 aa30.21■■■□□ 2.43
ZNF226-211ENST00000588742 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.19■■■□□ 2.42
ZNF226-211ENST00000588742 HMGXB3Q12766 1538 aa30.12■■■□□ 2.41
ZNF226-211ENST00000588742 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
ZNF226-211ENST00000588742 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.98■■■□□ 2.39
ZNF226-211ENST00000588742 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.95■■■□□ 2.39
ZNF226-211ENST00000588742 ERCC6Q03468 1493 aa29.8■■■□□ 2.36
ZNF226-211ENST00000588742 WIZO95785 1651 aa29.67■■■□□ 2.34
ZNF226-211ENST00000588742 NESP48681 1621 aa29.63■■■□□ 2.33
ZNF226-211ENST00000588742 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.59■■■□□ 2.33
ZNF226-211ENST00000588742 CUX2O14529 1486 aa29.56■■■□□ 2.32
ZNF226-211ENST00000588742 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
ZNF226-211ENST00000588742 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.38■■■□□ 2.29
ZNF226-211ENST00000588742 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.37■■■□□ 2.29
ZNF226-211ENST00000588742 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
ZNF226-211ENST00000588742 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.33■■■□□ 2.29
ZNF226-211ENST00000588742 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ZNF226-211ENST00000588742 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.11■■■□□ 2.25
ZNF226-211ENST00000588742 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.1■■■□□ 2.25
ZNF226-211ENST00000588742 CFTRP13569 1480 aa29.07■■■□□ 2.24
ZNF226-211ENST00000588742 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.05■■■□□ 2.24
ZNF226-211ENST00000588742 PRDM2Q13029 1718 aa29■■■□□ 2.23
ZNF226-211ENST00000588742 WDR62O43379 1518 aa29■■■□□ 2.23
ZNF226-211ENST00000588742 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.99■■■□□ 2.23
ZNF226-211ENST00000588742 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.92■■■□□ 2.22
ZNF226-211ENST00000588742 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
ZNF226-211ENST00000588742 ABCC8Q09428 1581 aa28.54■■■□□ 2.16
ZNF226-211ENST00000588742 TOPBP1Q92547 1522 aa28.53■■■□□ 2.16
ZNF226-211ENST00000588742 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.5■■■□□ 2.15
ZNF226-211ENST00000588742 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
ZNF226-211ENST00000588742 IFT140Q96RY7 1462 aa28.47■■■□□ 2.15
ZNF226-211ENST00000588742 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
ZNF226-211ENST00000588742 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
ZNF226-211ENST00000588742 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
ZNF226-211ENST00000588742 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
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ZNF226-211ENST00000588742 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.15■■■□□ 2.1
ZNF226-211ENST00000588742 CUX1P39880 1505 aa28.14■■■□□ 2.1
ZNF226-211ENST00000588742 SOGA1O94964 1423 aa28.12■■■□□ 2.09
ZNF226-211ENST00000588742 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.11■■■□□ 2.09
ZNF226-211ENST00000588742 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.094e-8■■■■■ 52.2
ZNF226-211ENST00000588742 WDR97A6NE52 1622 aa28.07■■■□□ 2.08
ZNF226-211ENST00000588742 CHD1O14646 1710 aa28.04■■■□□ 2.08
ZNF226-211ENST00000588742 TRIM41Q8WV44 630 aa28■■■□□ 2.07
ZNF226-211ENST00000588742 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
ZNF226-211ENST00000588742 FBLN2P98095 1184 aa27.93■■■□□ 2.06
ZNF226-211ENST00000588742 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.9■■■□□ 2.06
ZNF226-211ENST00000588742 PBRM1Q86U86 1689 aa27.88■■■□□ 2.05
ZNF226-211ENST00000588742 GRIN2BQ13224 1484 aa27.88■■■□□ 2.05
ZNF226-211ENST00000588742 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.87■■■□□ 2.05
ZNF226-211ENST00000588742 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.87■■■□□ 2.05
ZNF226-211ENST00000588742 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.87■■■□□ 2.05
ZNF226-211ENST00000588742 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.86■■■□□ 2.05
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ZNF226-211ENST00000588742 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
ZNF226-211ENST00000588742 TOP2BQ02880 1626 aa27.85■■■□□ 2.05
ZNF226-211ENST00000588742 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.83■■■□□ 2.05
ZNF226-211ENST00000588742 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.82■■■□□ 2.04
ZNF226-211ENST00000588742 ARHGEF11O15085 1522 aa27.8■■■□□ 2.04
ZNF226-211ENST00000588742 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.79■■■□□ 2.04
ZNF226-211ENST00000588742 SYNJ1O43426 1573 aa27.79■■■□□ 2.04
ZNF226-211ENST00000588742 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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ZNF226-211ENST00000588742 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.53■■■□□ 2
ZNF226-211ENST00000588742 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.53■■■□□ 2
ZNF226-211ENST00000588742 ARAP1Q96P48 1450 aa27.52■■■□□ 2
ZNF226-211ENST00000588742 GRIN2AQ12879 1464 aa27.51■■■□□ 2
ZNF226-211ENST00000588742 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.48■■□□□ 1.99
ZNF226-211ENST00000588742 CEP170Q5SW79 1584 aa27.39■■□□□ 1.97
ZNF226-211ENST00000588742 NUP160Q12769 1436 aa27.36■■□□□ 1.97
ZNF226-211ENST00000588742 KIF27Q86VH2 1401 aa27.33■■□□□ 1.96
ZNF226-211ENST00000588742 CUL7Q14999 1698 aa27.27■■□□□ 1.96
ZNF226-211ENST00000588742 SHROOM2Q13796 1616 aa27.23■■□□□ 1.95
ZNF226-211ENST00000588742 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
ZNF226-211ENST00000588742 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.18■■□□□ 1.94
ZNF226-211ENST00000588742 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.18■■□□□ 1.94
ZNF226-211ENST00000588742 IGF1RP08069 1367 aa27.13■■□□□ 1.93
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