Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.263e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.63e-11■□□□□ 9
PABPC4Q13310 COTL1-202ENST00000561707 781 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.066e-7■□□□□ 9
PABPC4Q13310 PRSS21-207ENST00000574813 873 ntTSL 322.46■■□□□ 1.199e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.995e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.615e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SLC25A32-205ENST00000523866 1347 ntTSL 223.04■■□□□ 1.285e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C8orf33-202ENST00000524395 1125 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.035e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.815e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.785e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C8orf33-205ENST00000534350 1329 ntTSL 419.7■□□□□ 0.745e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.695e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.415e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C8orf33-204ENST00000530455 2676 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.345e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.325e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SLC25A32-203ENST00000523256 2711 ntTSL 516.74■□□□□ 0.275e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SLC25A32-202ENST00000521645 2815 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.125e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 VCP-204ENST00000466100 508 ntTSL 212.92□□□□□ -0.345e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.26e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 USP33-209ENST00000481579 2866 ntTSL 26.32□□□□□ -1.45e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.765e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TRA2A-206ENST00000482395 661 ntTSL 225.06■■□□□ 1.61e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.661e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.471e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TRA2A-210ENST00000497730 455 ntTSL 38.3□□□□□ -1.081e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TRA2A-207ENST00000486934 417 ntTSL 27.65□□□□□ -1.181e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TRA2A-205ENST00000475970 394 ntTSL 25.52□□□□□ -1.531e-28■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.174e-12■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.234e-9■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RACK1-209ENST00000504128 990 ntTSL 210.05□□□□□ -0.87e-42■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.838e-14■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 27.14□□□□□ -1.278e-14■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 25.6□□□□□ -1.518e-14■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 34.49□□□□□ -1.698e-14■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.464e-10■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.981e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.961e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.691e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CD37-202ENST00000391859 1588 ntTSL 218.11■□□□□ 0.491e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CD37-212ENST00000597852 3172 ntTSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.281e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ADGB-210ENST00000522242 607 ntTSL 415.41■□□□□ 0.061e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.031e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 CD37-208ENST00000595725 1121 ntTSL 214.62□□□□□ -0.071e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 FXR1-208ENST00000469882 570 ntTSL 313.6□□□□□ -0.231e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.251e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 FXR1-206ENST00000465551 572 ntTSL 411.09□□□□□ -0.631e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ZDHHC5-207ENST00000529480 3546 ntTSL 1 (best)9.79□□□□□ -0.841e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 FXR1-218ENST00000484790 571 ntTSL 49.06□□□□□ -0.961e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 KPNB1-210ENST00000580573 556 ntTSL 39.02□□□□□ -0.971e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PLEKHA2-202ENST00000518939 669 ntTSL 58.68□□□□□ -1.021e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 FXR1-219ENST00000484958 824 ntTSL 38.57□□□□□ -1.041e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 FXR1-217ENST00000484042 562 ntTSL 47.39□□□□□ -1.231e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ADGB-202ENST00000326929 2328 ntTSL 27.28□□□□□ -1.241e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.291e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ADGB-211ENST00000522396 571 ntTSL 46.25□□□□□ -1.411e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.581e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ADGB-209ENST00000493950 6779 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.651e-5■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ATP5O-207ENST00000487374 469 ntTSL 517.64■□□□□ 0.411e-9■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ATP5O-209ENST00000495005 586 ntTSL 212.55□□□□□ -0.41e-9■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.815e-12■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.745e-12■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 LMNA-222ENST00000508500 848 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.745e-12■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 LMNA-217ENST00000498722 1348 ntTSL 219.09■□□□□ 0.655e-12■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.55e-12■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 SEC11A-204ENST00000558196 540 ntTSL 39.57□□□□□ -0.883e-9■□□□□ 8.9
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PABPC4Q13310 RACK1-233ENST00000514455 791 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.559e-42■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RACK1-222ENST00000509535 456 ntTSL 310.72□□□□□ -0.699e-42■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.162e-21■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.052e-21■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 AK2-207ENST00000482191 599 ntTSL 215.31■□□□□ 0.042e-21■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 AK2-209ENST00000491241 596 ntTSL 313.01□□□□□ -0.332e-21■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.024e-6■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.184e-6■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TNRC6A-207ENST00000491718 7956 ntTSL 1 (best)6.94□□□□□ -1.34e-6■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 TNRC6A-216ENST00000569098 587 ntTSL 56.16□□□□□ -1.424e-6■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.569e-12■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.531e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.281e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.11e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.031e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.021e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.941e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.761e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-211ENST00000592486 2314 nt17.64■□□□□ 0.411e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-7■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RACK1-216ENST00000507273 358 ntTSL 210.05□□□□□ -0.81e-41■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RER1-206ENST00000462129 585 ntTSL 221.46■■□□□ 1.031e-6■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-6■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RBBP4-201ENST00000373485 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.684e-27■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.074e-27■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RBBP4-212ENST00000482190 616 ntTSL 35.08□□□□□ -1.64e-27■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 RBBP4-207ENST00000460669 783 ntTSL 54.96□□□□□ -1.624e-27■□□□□ 8.9
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