Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms