RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569574.1

LMF1-AS1-202, LMF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LMF1-AS1, Length 1,408 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1-AS1-202ENST00000569574 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.29■■■■□ 3.72
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.96■■■■□ 3.03
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ABCC9O60706 1549 aa33.26■■■□□ 2.91
LMF1-AS1-202ENST00000569574 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.05■■■□□ 2.72
LMF1-AS1-202ENST00000569574 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.01■■■□□ 2.72
LMF1-AS1-202ENST00000569574 NACADO15069 1562 aa32■■■□□ 2.71
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
LMF1-AS1-202ENST00000569574 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.84■■■□□ 2.69
LMF1-AS1-202ENST00000569574 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.71■■■□□ 2.67
LMF1-AS1-202ENST00000569574 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
LMF1-AS1-202ENST00000569574 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.11■■■□□ 2.57
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SCRIBQ14160 1630 aa31.01■■■□□ 2.55
LMF1-AS1-202ENST00000569574 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.98■■■□□ 2.55
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.77■■■□□ 2.52
LMF1-AS1-202ENST00000569574 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.48■■■□□ 2.47
LMF1-AS1-202ENST00000569574 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.05■■■□□ 2.4
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.91■■■□□ 2.38
LMF1-AS1-202ENST00000569574 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SMARCA4P51532 1647 aa29.67■■■□□ 2.34
LMF1-AS1-202ENST00000569574 NCAPD3P42695 1498 aa29.55■■■□□ 2.32
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.55■■■□□ 2.32
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SMARCA2P51531 1590 aa29.52■■■□□ 2.32
LMF1-AS1-202ENST00000569574 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.49■■■□□ 2.31
LMF1-AS1-202ENST00000569574 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.4■■■□□ 2.3
LMF1-AS1-202ENST00000569574 HMGXB3Q12766 1538 aa29.38■■■□□ 2.29
LMF1-AS1-202ENST00000569574 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
LMF1-AS1-202ENST00000569574 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
LMF1-AS1-202ENST00000569574 WIZO95785 1651 aa29.12■■■□□ 2.25
LMF1-AS1-202ENST00000569574 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
LMF1-AS1-202ENST00000569574 NESP48681 1621 aa28.76■■■□□ 2.19
LMF1-AS1-202ENST00000569574 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.73■■■□□ 2.19
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ERCC6Q03468 1493 aa28.72■■■□□ 2.19
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.71■■■□□ 2.19
LMF1-AS1-202ENST00000569574 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.61■■■□□ 2.17
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.55■■■□□ 2.16
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CFTRP13569 1480 aa28.52■■■□□ 2.16
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CUX2O14529 1486 aa28.39■■■□□ 2.14
LMF1-AS1-202ENST00000569574 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.35■■■□□ 2.13
LMF1-AS1-202ENST00000569574 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.35■■■□□ 2.13
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.32■■■□□ 2.12
LMF1-AS1-202ENST00000569574 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
LMF1-AS1-202ENST00000569574 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.27■■■□□ 2.12
LMF1-AS1-202ENST00000569574 WDR62O43379 1518 aa28.15■■■□□ 2.1
LMF1-AS1-202ENST00000569574 PRDM2Q13029 1718 aa28.14■■■□□ 2.1
LMF1-AS1-202ENST00000569574 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ABCC8Q09428 1581 aa27.94■■■□□ 2.06
LMF1-AS1-202ENST00000569574 TOPBP1Q92547 1522 aa27.88■■■□□ 2.05
LMF1-AS1-202ENST00000569574 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.84■■■□□ 2.05
LMF1-AS1-202ENST00000569574 IFT140Q96RY7 1462 aa27.73■■■□□ 2.03
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CUX1P39880 1505 aa27.66■■■□□ 2.02
LMF1-AS1-202ENST00000569574 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
LMF1-AS1-202ENST00000569574 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.59■■■□□ 2.01
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SOGA1O94964 1423 aa27.57■■■□□ 2
LMF1-AS1-202ENST00000569574 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
LMF1-AS1-202ENST00000569574 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.53■■■□□ 2
LMF1-AS1-202ENST00000569574 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
LMF1-AS1-202ENST00000569574 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.49■■□□□ 1.99
LMF1-AS1-202ENST00000569574 TOP2BQ02880 1626 aa27.44■■□□□ 1.98
LMF1-AS1-202ENST00000569574 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
LMF1-AS1-202ENST00000569574 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SYNJ1O43426 1573 aa27.41■■□□□ 1.98
LMF1-AS1-202ENST00000569574 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
LMF1-AS1-202ENST00000569574 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.39■■□□□ 1.98
LMF1-AS1-202ENST00000569574 WDR97A6NE52 1622 aa27.37■■□□□ 1.97
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.34■■□□□ 1.97
LMF1-AS1-202ENST00000569574 OSCARQ8IYS5 282 aa27.27■■□□□ 1.96
LMF1-AS1-202ENST00000569574 GRIN2BQ13224 1484 aa27.25■■□□□ 1.95
LMF1-AS1-202ENST00000569574 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.25■■□□□ 1.95
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.19■■□□□ 1.94
LMF1-AS1-202ENST00000569574 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.17■■□□□ 1.94
LMF1-AS1-202ENST00000569574 FBLN2P98095 1184 aa27.15■■□□□ 1.94
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
LMF1-AS1-202ENST00000569574 SYNJ2O15056 1496 aa27.06■■□□□ 1.92
LMF1-AS1-202ENST00000569574 PBRM1Q86U86 1689 aa27.06■■□□□ 1.92
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.01■■□□□ 1.91
LMF1-AS1-202ENST00000569574 KIF27Q86VH2 1401 aa27.01■■□□□ 1.91
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CHD1O14646 1710 aa27■■□□□ 1.91
LMF1-AS1-202ENST00000569574 TRIM41Q8WV44 630 aa26.98■■□□□ 1.91
LMF1-AS1-202ENST00000569574 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.95■■□□□ 1.91
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ADAMTS12P58397 1594 aa26.92■■□□□ 1.9
LMF1-AS1-202ENST00000569574 GRIN2AQ12879 1464 aa26.88■■□□□ 1.89
LMF1-AS1-202ENST00000569574 IGF1RP08069 1367 aa26.86■■□□□ 1.89
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.8■■□□□ 1.88
LMF1-AS1-202ENST00000569574 NUP160Q12769 1436 aa26.77■■□□□ 1.88
LMF1-AS1-202ENST00000569574 ARHGEF11O15085 1522 aa26.75■■□□□ 1.87
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CUL7Q14999 1698 aa26.74■■□□□ 1.87
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.73■■□□□ 1.87
LMF1-AS1-202ENST00000569574 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
LMF1-AS1-202ENST00000569574 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
LMF1-AS1-202ENST00000569574 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CEP170Q5SW79 1584 aa26.69■■□□□ 1.86
LMF1-AS1-202ENST00000569574 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.68■■□□□ 1.86
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.63■■□□□ 1.85
LMF1-AS1-202ENST00000569574 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.56■■□□□ 1.84
LMF1-AS1-202ENST00000569574 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.56■■□□□ 1.84
LMF1-AS1-202ENST00000569574 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.53■■□□□ 1.84
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