Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CUL4AQ13619 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CUL4AQ13619 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CUL4AQ13619 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CUL4AQ13619 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CUL4AQ13619 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CUL4AQ13619 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CUL4AQ13619 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CUL4AQ13619 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CUL4AQ13619 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CUL4AQ13619 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CUL4AQ13619 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CUL4AQ13619 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CUL4AQ13619 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CUL4AQ13619 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CUL4AQ13619 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CUL4AQ13619 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CUL4AQ13619 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CUL4AQ13619 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CUL4AQ13619 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CUL4AQ13619 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CUL4AQ13619 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CUL4AQ13619 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CUL4AQ13619 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CUL4AQ13619 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CUL4AQ13619 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CUL4AQ13619 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CUL4AQ13619 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CUL4AQ13619 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CUL4AQ13619 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CUL4AQ13619 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUL4AQ13619 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CUL4AQ13619 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CUL4AQ13619 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CUL4AQ13619 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CUL4AQ13619 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CUL4AQ13619 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CUL4AQ13619 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CUL4AQ13619 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CUL4AQ13619 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CUL4AQ13619 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CUL4AQ13619 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CUL4AQ13619 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CUL4AQ13619 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CUL4AQ13619 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CUL4AQ13619 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CUL4AQ13619 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CUL4AQ13619 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CUL4AQ13619 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CUL4AQ13619 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CUL4AQ13619 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CUL4AQ13619 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CUL4AQ13619 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CUL4AQ13619 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CUL4AQ13619 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CUL4AQ13619 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CUL4AQ13619 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CUL4AQ13619 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CUL4AQ13619 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CUL4AQ13619 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CUL4AQ13619 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CUL4AQ13619 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CUL4AQ13619 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CUL4AQ13619 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CUL4AQ13619 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CUL4AQ13619 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CUL4AQ13619 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CUL4AQ13619 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CUL4AQ13619 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CUL4AQ13619 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CUL4AQ13619 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CUL4AQ13619 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CUL4AQ13619 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CUL4AQ13619 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CUL4AQ13619 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CUL4AQ13619 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CUL4AQ13619 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CUL4AQ13619 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CUL4AQ13619 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CUL4AQ13619 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUL4AQ13619 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CUL4AQ13619 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CUL4AQ13619 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CUL4AQ13619 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CUL4AQ13619 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CUL4AQ13619 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CUL4AQ13619 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CUL4AQ13619 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CUL4AQ13619 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CUL4AQ13619 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CUL4AQ13619 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUL4AQ13619 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUL4AQ13619 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CUL4AQ13619 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CUL4AQ13619 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CUL4AQ13619 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUL4AQ13619 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUL4AQ13619 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUL4AQ13619 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CUL4AQ13619 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
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