RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614916.1

5S_rRNA.22-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 106 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.59■■■■□ 3.77
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.41■■■■□ 3.1
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ABCC9O60706 1549 aa33.78■■■■□ 3
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.36■■■□□ 2.77
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.32■■■□□ 2.76
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 NACADO15069 1562 aa32.31■■■□□ 2.76
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.15■■■□□ 2.74
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32■■■□□ 2.71
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.69■■■□□ 2.66
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.65
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.48■■■□□ 2.63
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SCRIBQ14160 1630 aa31.31■■■□□ 2.6
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.28■■■□□ 2.6
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.08■■■□□ 2.57
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.53■■■□□ 2.48
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.35■■■□□ 2.45
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SMARCA4P51532 1647 aa29.95■■■□□ 2.38
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 NCAPD3P42695 1498 aa29.87■■■□□ 2.37
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.86■■■□□ 2.37
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SMARCA2P51531 1590 aa29.77■■■□□ 2.36
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.77■■■□□ 2.36
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.7■■■□□ 2.35
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 HMGXB3Q12766 1538 aa29.66■■■□□ 2.34
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 WIZO95785 1651 aa29.43■■■□□ 2.3
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 NESP48681 1621 aa29.22■■■□□ 2.27
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ERCC6Q03468 1493 aa29.04■■■□□ 2.24
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.04■■■□□ 2.24
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.98■■■□□ 2.23
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.86■■■□□ 2.21
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CUX2O14529 1486 aa28.81■■■□□ 2.2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.8■■■□□ 2.2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.78■■■□□ 2.2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CFTRP13569 1480 aa28.78■■■□□ 2.2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PRDM2Q13029 1718 aa28.64■■■□□ 2.18
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.63■■■□□ 2.17
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.57■■■□□ 2.16
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.57■■■□□ 2.16
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 WDR62O43379 1518 aa28.49■■■□□ 2.15
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.21■■■□□ 2.11
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 TOPBP1Q92547 1522 aa28.17■■■□□ 2.1
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ABCC8Q09428 1581 aa28.15■■■□□ 2.1
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.08■■■□□ 2.09
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 IFT140Q96RY7 1462 aa27.98■■■□□ 2.07
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CUX1P39880 1505 aa27.92■■■□□ 2.06
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.83■■■□□ 2.05
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.83■■■□□ 2.04
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SOGA1O94964 1423 aa27.81■■■□□ 2.04
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.04
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.7■■■□□ 2.03
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 WDR97A6NE52 1622 aa27.69■■■□□ 2.02
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 TOP2BQ02880 1626 aa27.68■■■□□ 2.02
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 OSCARQ8IYS5 282 aa27.65■■■□□ 2.02
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SYNJ1O43426 1573 aa27.63■■■□□ 2.01
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.54■■■□□ 2
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 GRIN2BQ13224 1484 aa27.46■■□□□ 1.99
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.46■■□□□ 1.99
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.45■■□□□ 1.99
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.45■■□□□ 1.98
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CHD1O14646 1710 aa27.44■■□□□ 1.98
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 PBRM1Q86U86 1689 aa27.43■■□□□ 1.98
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 FBLN2P98095 1184 aa27.42■■□□□ 1.98
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SYNJ2O15056 1496 aa27.3■■□□□ 1.96
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.23■■□□□ 1.95
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.19■■□□□ 1.94
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.19■■□□□ 1.94
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.19■■□□□ 1.94
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ADAMTS12P58397 1594 aa27.18■■□□□ 1.94
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ARHGEF11O15085 1522 aa27.18■■□□□ 1.94
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 TRIM41Q8WV44 630 aa27.17■■□□□ 1.94
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.16■■□□□ 1.94
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.13■■□□□ 1.93
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 KIF27Q86VH2 1401 aa27.13■■□□□ 1.93
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 GRIN2AQ12879 1464 aa27.13■■□□□ 1.93
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 IGF1RP08069 1367 aa27.07■■□□□ 1.92
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 NUP160Q12769 1436 aa27.03■■□□□ 1.92
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CUL7Q14999 1698 aa27.02■■□□□ 1.92
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CEP170Q5SW79 1584 aa27.01■■□□□ 1.92
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.99■■□□□ 1.91
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ARAP1Q96P48 1450 aa26.98■■□□□ 1.91
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.9■■□□□ 1.9
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.85■■□□□ 1.89
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.84■■□□□ 1.89
5S_rRNA.22-201ENST00000614916 SHROOM2Q13796 1616 aa26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms