Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4BQ13620 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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