Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CUL4BQ13620 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CUL4BQ13620 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CUL4BQ13620 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CUL4BQ13620 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CUL4BQ13620 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CUL4BQ13620 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUL4BQ13620 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CUL4BQ13620 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CUL4BQ13620 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CUL4BQ13620 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUL4BQ13620 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CUL4BQ13620 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CUL4BQ13620 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CUL4BQ13620 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CUL4BQ13620 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CUL4BQ13620 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CUL4BQ13620 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CUL4BQ13620 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CUL4BQ13620 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CUL4BQ13620 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CUL4BQ13620 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CUL4BQ13620 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CUL4BQ13620 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CUL4BQ13620 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CUL4BQ13620 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CUL4BQ13620 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CUL4BQ13620 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CUL4BQ13620 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CUL4BQ13620 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CUL4BQ13620 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CUL4BQ13620 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CUL4BQ13620 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CUL4BQ13620 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CUL4BQ13620 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CUL4BQ13620 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CUL4BQ13620 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CUL4BQ13620 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CUL4BQ13620 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CUL4BQ13620 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUL4BQ13620 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUL4BQ13620 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUL4BQ13620 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CUL4BQ13620 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CUL4BQ13620 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CUL4BQ13620 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CUL4BQ13620 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CUL4BQ13620 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CUL4BQ13620 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CUL4BQ13620 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CUL4BQ13620 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUL4BQ13620 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUL4BQ13620 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUL4BQ13620 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CUL4BQ13620 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUL4BQ13620 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUL4BQ13620 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CUL4BQ13620 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CUL4BQ13620 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CUL4BQ13620 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CUL4BQ13620 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CUL4BQ13620 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CUL4BQ13620 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CUL4BQ13620 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CUL4BQ13620 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CUL4BQ13620 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CUL4BQ13620 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CUL4BQ13620 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CUL4BQ13620 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CUL4BQ13620 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CUL4BQ13620 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CUL4BQ13620 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CUL4BQ13620 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CUL4BQ13620 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CUL4BQ13620 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CUL4BQ13620 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CUL4BQ13620 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CUL4BQ13620 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CUL4BQ13620 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CUL4BQ13620 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CUL4BQ13620 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CUL4BQ13620 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CUL4BQ13620 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CUL4BQ13620 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CUL4BQ13620 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CUL4BQ13620 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CUL4BQ13620 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CUL4BQ13620 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CUL4BQ13620 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CUL4BQ13620 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CUL4BQ13620 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUL4BQ13620 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUL4BQ13620 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUL4BQ13620 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUL4BQ13620 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CUL4BQ13620 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CUL4BQ13620 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CUL4BQ13620 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CUL4BQ13620 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
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