Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAAF3Q8N9W5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAAF3Q8N9W5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms