RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583539.5

RAD51C-215, Transcript of RAD51 paralog C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene RAD51C, Length 1,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51C-215ENST00000583539 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.06■■■■□ 3.84
RAD51C-215ENST00000583539 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.9■■■■□ 3.18
RAD51C-215ENST00000583539 ABCC9O60706 1549 aa34.2■■■■□ 3.07
RAD51C-215ENST00000583539 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.92■■■□□ 2.86
RAD51C-215ENST00000583539 NACADO15069 1562 aa32.82■■■□□ 2.84
RAD51C-215ENST00000583539 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.68■■■□□ 2.82
RAD51C-215ENST00000583539 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.57■■■□□ 2.8
RAD51C-215ENST00000583539 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
RAD51C-215ENST00000583539 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.36■■■□□ 2.77
RAD51C-215ENST00000583539 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.12■■■□□ 2.73
RAD51C-215ENST00000583539 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.88■■■□□ 2.69
RAD51C-215ENST00000583539 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.82■■■□□ 2.68
RAD51C-215ENST00000583539 SCRIBQ14160 1630 aa31.76■■■□□ 2.68
RAD51C-215ENST00000583539 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.62■■■□□ 2.65
RAD51C-215ENST00000583539 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.41■■■□□ 2.62
RAD51C-215ENST00000583539 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
RAD51C-215ENST00000583539 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.96■■■□□ 2.55
RAD51C-215ENST00000583539 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.78■■■□□ 2.52
RAD51C-215ENST00000583539 SMARCA4P51532 1647 aa30.37■■■□□ 2.45
RAD51C-215ENST00000583539 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
RAD51C-215ENST00000583539 SMARCA2P51531 1590 aa30.25■■■□□ 2.43
RAD51C-215ENST00000583539 NCAPD3P42695 1498 aa30.24■■■□□ 2.43
RAD51C-215ENST00000583539 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.21■■■□□ 2.43
RAD51C-215ENST00000583539 HMGXB3Q12766 1538 aa30.12■■■□□ 2.41
RAD51C-215ENST00000583539 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.08■■■□□ 2.41
RAD51C-215ENST00000583539 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.06■■■□□ 2.4
RAD51C-215ENST00000583539 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
RAD51C-215ENST00000583539 WIZO95785 1651 aa29.76■■■□□ 2.35
RAD51C-215ENST00000583539 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
RAD51C-215ENST00000583539 ERCC6Q03468 1493 aa29.58■■■□□ 2.33
RAD51C-215ENST00000583539 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.53■■■□□ 2.32
RAD51C-215ENST00000583539 NESP48681 1621 aa29.51■■■□□ 2.32
RAD51C-215ENST00000583539 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
RAD51C-215ENST00000583539 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.35■■■□□ 2.29
RAD51C-215ENST00000583539 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.32■■■□□ 2.28
RAD51C-215ENST00000583539 CUX2O14529 1486 aa29.32■■■□□ 2.28
RAD51C-215ENST00000583539 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.23■■■□□ 2.27
RAD51C-215ENST00000583539 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
RAD51C-215ENST00000583539 CFTRP13569 1480 aa29.14■■■□□ 2.25
RAD51C-215ENST00000583539 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.06■■■□□ 2.24
RAD51C-215ENST00000583539 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.05■■■□□ 2.24
RAD51C-215ENST00000583539 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.03■■■□□ 2.24
RAD51C-215ENST00000583539 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.02■■■□□ 2.24
RAD51C-215ENST00000583539 PRDM2Q13029 1718 aa29■■■□□ 2.23
RAD51C-215ENST00000583539 WDR62O43379 1518 aa28.92■■■□□ 2.22
RAD51C-215ENST00000583539 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
RAD51C-215ENST00000583539 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
RAD51C-215ENST00000583539 ABCC8Q09428 1581 aa28.6■■■□□ 2.17
RAD51C-215ENST00000583539 TOPBP1Q92547 1522 aa28.54■■■□□ 2.16
RAD51C-215ENST00000583539 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.52■■■□□ 2.16
RAD51C-215ENST00000583539 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.52■■■□□ 2.16
RAD51C-215ENST00000583539 IFT140Q96RY7 1462 aa28.43■■■□□ 2.14
RAD51C-215ENST00000583539 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
RAD51C-215ENST00000583539 CUX1P39880 1505 aa28.23■■■□□ 2.11
RAD51C-215ENST00000583539 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
RAD51C-215ENST00000583539 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
RAD51C-215ENST00000583539 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
RAD51C-215ENST00000583539 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.19■■■□□ 2.1
RAD51C-215ENST00000583539 SOGA1O94964 1423 aa28.16■■■□□ 2.1
RAD51C-215ENST00000583539 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.11■■■□□ 2.09
RAD51C-215ENST00000583539 WDR97A6NE52 1622 aa28.11■■■□□ 2.09
RAD51C-215ENST00000583539 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
RAD51C-215ENST00000583539 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
RAD51C-215ENST00000583539 OSCARQ8IYS5 282 aa28.03■■■□□ 2.08
RAD51C-215ENST00000583539 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28■■■□□ 2.07
RAD51C-215ENST00000583539 TOP2BQ02880 1626 aa28■■■□□ 2.07
RAD51C-215ENST00000583539 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
RAD51C-215ENST00000583539 SYNJ1O43426 1573 aa27.93■■■□□ 2.06
RAD51C-215ENST00000583539 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.92■■■□□ 2.06
RAD51C-215ENST00000583539 GRIN2BQ13224 1484 aa27.89■■■□□ 2.06
RAD51C-215ENST00000583539 CHD1O14646 1710 aa27.88■■■□□ 2.05
RAD51C-215ENST00000583539 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.85■■■□□ 2.05
RAD51C-215ENST00000583539 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.85■■■□□ 2.05
RAD51C-215ENST00000583539 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
RAD51C-215ENST00000583539 PBRM1Q86U86 1689 aa27.84■■■□□ 2.05
RAD51C-215ENST00000583539 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.83■■■□□ 2.05
RAD51C-215ENST00000583539 FBLN2P98095 1184 aa27.8■■■□□ 2.04
RAD51C-215ENST00000583539 SYNJ2O15056 1496 aa27.72■■■□□ 2.03
RAD51C-215ENST00000583539 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
RAD51C-215ENST00000583539 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.62■■■□□ 2.01
RAD51C-215ENST00000583539 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.6■■■□□ 2.01
RAD51C-215ENST00000583539 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.6■■■□□ 2.01
RAD51C-215ENST00000583539 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.6■■■□□ 2.01
RAD51C-215ENST00000583539 ADAMTS12P58397 1594 aa27.59■■■□□ 2.01
RAD51C-215ENST00000583539 ARHGEF11O15085 1522 aa27.58■■■□□ 2.01
RAD51C-215ENST00000583539 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.55■■■□□ 2
RAD51C-215ENST00000583539 TRIM41Q8WV44 630 aa27.54■■■□□ 2
RAD51C-215ENST00000583539 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.53■■■□□ 2
RAD51C-215ENST00000583539 GRIN2AQ12879 1464 aa27.52■■■□□ 2
RAD51C-215ENST00000583539 KIF27Q86VH2 1401 aa27.48■■□□□ 1.99
RAD51C-215ENST00000583539 NUP160Q12769 1436 aa27.38■■□□□ 1.97
RAD51C-215ENST00000583539 CUL7Q14999 1698 aa27.37■■□□□ 1.97
RAD51C-215ENST00000583539 CEP170Q5SW79 1584 aa27.37■■□□□ 1.97
RAD51C-215ENST00000583539 ARAP1Q96P48 1450 aa27.32■■□□□ 1.96
RAD51C-215ENST00000583539 IGF1RP08069 1367 aa27.29■■□□□ 1.96
RAD51C-215ENST00000583539 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.29■■□□□ 1.96
RAD51C-215ENST00000583539 SHROOM2Q13796 1616 aa27.22■■□□□ 1.95
RAD51C-215ENST00000583539 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.18■■□□□ 1.94
RAD51C-215ENST00000583539 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.18■■□□□ 1.94
RAD51C-215ENST00000583539 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.1 ms