RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636154.2

RAB34-223, Transcript of RAB34, member RAS oncogene family, human

TSL 2 BASIC

Gene RAB34, Length 730 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB34-223	ENST00000636154	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.19	■■■■□ 3.86
RAB34-223	ENST00000636154	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.98	■■■■□ 3.19
RAB34-223	ENST00000636154	ABCC9	O60706	1549 aa		34.25	■■■■□ 3.07
RAB34-223	ENST00000636154	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33	■■■□□ 2.87
RAB34-223	ENST00000636154	NACAD	O15069	1562 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RAB34-223	ENST00000636154	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RAB34-223	ENST00000636154	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RAB34-223	ENST00000636154	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
RAB34-223	ENST00000636154	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RAB34-223	ENST00000636154	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RAB34-223	ENST00000636154	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.93	■■■□□ 2.7
RAB34-223	ENST00000636154	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RAB34-223	ENST00000636154	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAB34-223	ENST00000636154	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB34-223	ENST00000636154	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.5	■■■□□ 2.63
RAB34-223	ENST00000636154	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
RAB34-223	ENST00000636154	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.02	■■■□□ 2.56
RAB34-223	ENST00000636154	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.85	■■■□□ 2.53
RAB34-223	ENST00000636154	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.44	■■■□□ 2.46
RAB34-223	ENST00000636154	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.43	■■■□□ 2.46
RAB34-223	ENST00000636154	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.36	■■■□□ 2.45
RAB34-223	ENST00000636154	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.34	■■■□□ 2.45
RAB34-223	ENST00000636154	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.31	■■■□□ 2.44
RAB34-223	ENST00000636154	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.22	■■■□□ 2.43
RAB34-223	ENST00000636154	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.2	■■■□□ 2.42
RAB34-223	ENST00000636154	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.14	■■■□□ 2.42
RAB34-223	ENST00000636154	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
RAB34-223	ENST00000636154	WIZ	O95785	1651 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB34-223	ENST00000636154	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
RAB34-223	ENST00000636154	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.62	■■■□□ 2.33
RAB34-223	ENST00000636154	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.6	■■■□□ 2.33
RAB34-223	ENST00000636154	NES	P48681	1621 aa		29.56	■■■□□ 2.32
RAB34-223	ENST00000636154	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.55	■■■□□ 2.32
RAB34-223	ENST00000636154	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.45	■■■□□ 2.31
RAB34-223	ENST00000636154	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.43	■■■□□ 2.3
RAB34-223	ENST00000636154	CUX2	O14529	1486 aa		29.42	■■■□□ 2.3
RAB34-223	ENST00000636154	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.25	■■■□□ 2.27
RAB34-223	ENST00000636154	CFTR	P13569	1480 aa		29.24	■■■□□ 2.27
RAB34-223	ENST00000636154	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
RAB34-223	ENST00000636154	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.15	■■■□□ 2.26
RAB34-223	ENST00000636154	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.11	■■■□□ 2.25
RAB34-223	ENST00000636154	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.1	■■■□□ 2.25
RAB34-223	ENST00000636154	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.1	■■■□□ 2.25
RAB34-223	ENST00000636154	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RAB34-223	ENST00000636154	WDR62	O43379	1518 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RAB34-223	ENST00000636154	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
RAB34-223	ENST00000636154	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RAB34-223	ENST00000636154	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.7	■■■□□ 2.18
RAB34-223	ENST00000636154	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RAB34-223	ENST00000636154	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RAB34-223	ENST00000636154	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RAB34-223	ENST00000636154	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.52	■■■□□ 2.16
RAB34-223	ENST00000636154	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
RAB34-223	ENST00000636154	CUX1	P39880	1505 aa		28.3	■■■□□ 2.12
RAB34-223	ENST00000636154	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
RAB34-223	ENST00000636154	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
RAB34-223	ENST00000636154	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.25	■■■□□ 2.11
RAB34-223	ENST00000636154	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
RAB34-223	ENST00000636154	SOGA1	O94964	1423 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RAB34-223	ENST00000636154	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.2	■■■□□ 2.1
RAB34-223	ENST00000636154	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RAB34-223	ENST00000636154	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.12	■■■□□ 2.09
RAB34-223	ENST00000636154	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RAB34-223	ENST00000636154	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.1	■■■□□ 2.09
RAB34-223	ENST00000636154	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RAB34-223	ENST00000636154	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RAB34-223	ENST00000636154	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
RAB34-223	ENST00000636154	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RAB34-223	ENST00000636154	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RAB34-223	ENST00000636154	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RAB34-223	ENST00000636154	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
RAB34-223	ENST00000636154	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RAB34-223	ENST00000636154	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RAB34-223	ENST00000636154	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RAB34-223	ENST00000636154	CHD1	O14646	1710 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RAB34-223	ENST00000636154	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RAB34-223	ENST00000636154	FBLN2	P98095	1184 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAB34-223	ENST00000636154	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAB34-223	ENST00000636154	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RAB34-223	ENST00000636154	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RAB34-223	ENST00000636154	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB34-223	ENST00000636154	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB34-223	ENST00000636154	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RAB34-223	ENST00000636154	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RAB34-223	ENST00000636154	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RAB34-223	ENST00000636154	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RAB34-223	ENST00000636154	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RAB34-223	ENST00000636154	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RAB34-223	ENST00000636154	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.56	■■■□□ 2
RAB34-223	ENST00000636154	TRIM41	Q8WV44	630 aa		27.55	■■■□□ 2
RAB34-223	ENST00000636154	NUP160	Q12769	1436 aa		27.48	■■□□□ 1.99
RAB34-223	ENST00000636154	CUL7	Q14999	1698 aa		27.42	■■□□□ 1.98
RAB34-223	ENST00000636154	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.41	■■□□□ 1.98
RAB34-223	ENST00000636154	IGF1R	P08069	1367 aa		27.4	■■□□□ 1.98
RAB34-223	ENST00000636154	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.39	■■□□□ 1.98
RAB34-223	ENST00000636154	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.35	■■□□□ 1.97
RAB34-223	ENST00000636154	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.28	■■□□□ 1.96
RAB34-223	ENST00000636154	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.25	■■□□□ 1.95
RAB34-223	ENST00000636154	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.25	■■□□□ 1.95
RAB34-223	ENST00000636154	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		27.18	■■□□□ 1.94

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