Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IKZF1Q13422 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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