RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476301.5

NECTIN3-AS1-204, NECTIN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene NECTIN3-AS1, Length 568 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.41■■■■■ 4.54
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCC9O60706 1549 aa40.42■■■■■ 4.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.22■■■■□ 3.87
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.89■■■■□ 3.82
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.89■■■■□ 3.66
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.61
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NACADO15069 1562 aa37.38■■■■□ 3.58
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.32■■■■□ 3.56
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.97■■■■□ 3.51
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.87■■■■□ 3.49
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.49■■■■□ 3.43
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.47■■■■□ 3.43
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.37■■■■□ 3.41
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.34■■■■□ 3.41
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.13■■■■□ 3.37
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SCRIBQ14160 1630 aa35.84■■■■□ 3.33
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.69■■■■□ 3.3
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CUX2O14529 1486 aa35.1■■■■□ 3.21
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ERCC6Q03468 1493 aa34.92■■■■□ 3.18
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NCAPD3P42695 1498 aa34.59■■■■□ 3.13
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NESP48681 1621 aa34.44■■■■□ 3.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TRIM41Q8WV44 630 aa34.44■■■■□ 3.1
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.38■■■■□ 3.09
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 HMGXB3Q12766 1538 aa34.16■■■■□ 3.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SMARCA2P51531 1590 aa34.15■■■■□ 3.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SMARCA4P51532 1647 aa34.03■■■■□ 3.04
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.9■■■■□ 3.02
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.83■■■■□ 3.01
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.81■■■■□ 3
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.65■■■□□ 2.98
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.56■■■□□ 2.96
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.54■■■□□ 2.96
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.49■■■□□ 2.95
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 OSCARQ8IYS5 282 aa33.49■■■□□ 2.95
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 WDR62O43379 1518 aa33.48■■■□□ 2.95
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.24■■■□□ 2.91
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.15■■■□□ 2.9
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.04■■■□□ 2.88
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.04■■■□□ 2.88
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.04■■■□□ 2.88
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 WIZO95785 1651 aa33.01■■■□□ 2.87
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CFTRP13569 1480 aa32.92■■■□□ 2.86
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ARHGEF11O15085 1522 aa32.86■■■□□ 2.85
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.83■■■□□ 2.85
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 IFT140Q96RY7 1462 aa32.61■■■□□ 2.81
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ARAP1Q96P48 1450 aa32.49■■■□□ 2.79
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FBLN2P98095 1184 aa32.41■■■□□ 2.78
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TOPBP1Q92547 1522 aa32.4■■■□□ 2.78
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CHD1O14646 1710 aa32.31■■■□□ 2.76
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PRDM2Q13029 1718 aa32.29■■■□□ 2.76
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.22■■■□□ 2.75
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCC8Q09428 1581 aa32.19■■■□□ 2.74
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.14■■■□□ 2.74
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.99■■■□□ 2.71
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.95■■■□□ 2.7
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.92■■■□□ 2.7
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SOGA1O94964 1423 aa31.9■■■□□ 2.7
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SYNJ1O43426 1573 aa31.82■■■□□ 2.68
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.75■■■□□ 2.67
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.68■■■□□ 2.66
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SYNJ2O15056 1496 aa31.67■■■□□ 2.66
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 GRIN2BQ13224 1484 aa31.67■■■□□ 2.66
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 WDR97A6NE52 1622 aa31.62■■■□□ 2.65
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CUX1P39880 1505 aa31.5■■■□□ 2.63
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.48■■■□□ 2.63
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PBRM1Q86U86 1689 aa31.38■■■□□ 2.61
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 CEP170Q5SW79 1584 aa31.28■■■□□ 2.6
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 GRIN2AQ12879 1464 aa31.27■■■□□ 2.6
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.23■■■□□ 2.59
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.22■■■□□ 2.59
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.2■■■□□ 2.59
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NUP160Q12769 1436 aa31.19■■■□□ 2.58
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.16■■■□□ 2.58
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.15■■■□□ 2.58
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 SHROOM2Q13796 1616 aa31.09■■■□□ 2.57
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ADAMTS12P58397 1594 aa31.07■■■□□ 2.56
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.01■■■□□ 2.56
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31■■■□□ 2.55
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.55
NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 JPH4Q96JJ6 628 aa30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms