Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IKZF1Q13422 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IKZF1Q13422 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IKZF1Q13422 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IKZF1Q13422 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKZF1Q13422 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKZF1Q13422 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IKZF1Q13422 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
IKZF1Q13422 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IKZF1Q13422 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IKZF1Q13422 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IKZF1Q13422 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IKZF1Q13422 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IKZF1Q13422 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IKZF1Q13422 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IKZF1Q13422 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKZF1Q13422 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IKZF1Q13422 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IKZF1Q13422 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IKZF1Q13422 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IKZF1Q13422 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IKZF1Q13422 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IKZF1Q13422 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IKZF1Q13422 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IKZF1Q13422 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKZF1Q13422 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IKZF1Q13422 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKZF1Q13422 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IKZF1Q13422 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IKZF1Q13422 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IKZF1Q13422 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IKZF1Q13422 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IKZF1Q13422 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IKZF1Q13422 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IKZF1Q13422 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IKZF1Q13422 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IKZF1Q13422 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IKZF1Q13422 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IKZF1Q13422 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IKZF1Q13422 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKZF1Q13422 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKZF1Q13422 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IKZF1Q13422 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IKZF1Q13422 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IKZF1Q13422 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKZF1Q13422 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKZF1Q13422 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IKZF1Q13422 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IKZF1Q13422 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IKZF1Q13422 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IKZF1Q13422 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IKZF1Q13422 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IKZF1Q13422 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IKZF1Q13422 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IKZF1Q13422 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IKZF1Q13422 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IKZF1Q13422 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IKZF1Q13422 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IKZF1Q13422 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IKZF1Q13422 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IKZF1Q13422 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKZF1Q13422 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKZF1Q13422 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKZF1Q13422 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKZF1Q13422 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKZF1Q13422 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKZF1Q13422 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKZF1Q13422 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKZF1Q13422 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKZF1Q13422 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKZF1Q13422 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKZF1Q13422 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKZF1Q13422 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IKZF1Q13422 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IKZF1Q13422 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKZF1Q13422 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKZF1Q13422 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKZF1Q13422 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKZF1Q13422 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKZF1Q13422 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKZF1Q13422 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKZF1Q13422 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKZF1Q13422 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKZF1Q13422 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKZF1Q13422 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF1Q13422 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKZF1Q13422 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKZF1Q13422 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF1Q13422 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKZF1Q13422 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKZF1Q13422 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKZF1Q13422 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKZF1Q13422 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKZF1Q13422 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKZF1Q13422 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKZF1Q13422 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKZF1Q13422 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKZF1Q13422 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKZF1Q13422 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKZF1Q13422 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms