RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352210.9

PPOX-201, Transcript of protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPOX, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOX-201ENST00000352210 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.83■■■■□ 3.01
PPOX-201ENST00000352210 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.7■■■□□ 2.35
PPOX-201ENST00000352210 ABCC9O60706 1549 aa28.91■■■□□ 2.22
PPOX-201ENST00000352210 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PPOX-201ENST00000352210 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.12■■■□□ 2.09
PPOX-201ENST00000352210 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.05■■■□□ 2.08
PPOX-201ENST00000352210 NACADO15069 1562 aa27.86■■■□□ 2.05
PPOX-201ENST00000352210 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.83■■■□□ 2.05
PPOX-201ENST00000352210 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.78■■■□□ 2.04
PPOX-201ENST00000352210 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.76■■■□□ 2.03
PPOX-201ENST00000352210 SCRIBQ14160 1630 aa27.26■■□□□ 1.95
PPOX-201ENST00000352210 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.24■■□□□ 1.95
PPOX-201ENST00000352210 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
PPOX-201ENST00000352210 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PPOX-201ENST00000352210 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.05■■□□□ 1.92
PPOX-201ENST00000352210 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PPOX-201ENST00000352210 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PPOX-201ENST00000352210 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.29■■□□□ 1.8
PPOX-201ENST00000352210 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.28■■□□□ 1.8
PPOX-201ENST00000352210 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.26■■□□□ 1.79
PPOX-201ENST00000352210 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PPOX-201ENST00000352210 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.12■■□□□ 1.77
PPOX-201ENST00000352210 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.08■■□□□ 1.77
PPOX-201ENST00000352210 SMARCA4P51532 1647 aa26.05■■□□□ 1.76
PPOX-201ENST00000352210 WIZO95785 1651 aa25.88■■□□□ 1.73
PPOX-201ENST00000352210 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.85■■□□□ 1.73
PPOX-201ENST00000352210 SMARCA2P51531 1590 aa25.77■■□□□ 1.72
PPOX-201ENST00000352210 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.75■■□□□ 1.71
PPOX-201ENST00000352210 NCAPD3P42695 1498 aa25.74■■□□□ 1.71
PPOX-201ENST00000352210 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PPOX-201ENST00000352210 HMGXB3Q12766 1538 aa25.64■■□□□ 1.7
PPOX-201ENST00000352210 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
PPOX-201ENST00000352210 TRIM41Q8WV44 630 aa25.54■■□□□ 1.68
PPOX-201ENST00000352210 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.42■■□□□ 1.66
PPOX-201ENST00000352210 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.17■■□□□ 1.62
PPOX-201ENST00000352210 NESP48681 1621 aa25.13■■□□□ 1.61
PPOX-201ENST00000352210 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.03■■□□□ 1.6
PPOX-201ENST00000352210 EEA1Q15075 1411 aa25■■□□□ 1.59
PPOX-201ENST00000352210 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.99■■□□□ 1.59
PPOX-201ENST00000352210 ABCC8Q09428 1581 aa24.99■■□□□ 1.59
PPOX-201ENST00000352210 CFTRP13569 1480 aa24.94■■□□□ 1.58
PPOX-201ENST00000352210 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PPOX-201ENST00000352210 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
PPOX-201ENST00000352210 ERCC6Q03468 1493 aa24.85■■□□□ 1.57
PPOX-201ENST00000352210 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.82■■□□□ 1.56
PPOX-201ENST00000352210 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.77■■□□□ 1.56
PPOX-201ENST00000352210 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.76■■□□□ 1.55
PPOX-201ENST00000352210 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PPOX-201ENST00000352210 PRDM2Q13029 1718 aa24.7■■□□□ 1.54
PPOX-201ENST00000352210 SYNJ1O43426 1573 aa24.7■■□□□ 1.54
PPOX-201ENST00000352210 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.69■■□□□ 1.54
PPOX-201ENST00000352210 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.68■■□□□ 1.54
PPOX-201ENST00000352210 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.66■■□□□ 1.54
PPOX-201ENST00000352210 SOGA1O94964 1423 aa24.65■■□□□ 1.54
PPOX-201ENST00000352210 TOP2BQ02880 1626 aa24.63■■□□□ 1.53
PPOX-201ENST00000352210 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PPOX-201ENST00000352210 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.61■■□□□ 1.53
PPOX-201ENST00000352210 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.59■■□□□ 1.53
PPOX-201ENST00000352210 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.58■■□□□ 1.53
PPOX-201ENST00000352210 GOLGA3Q08378 1498 aa24.56■■□□□ 1.52
PPOX-201ENST00000352210 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PPOX-201ENST00000352210 HRCP23327 699 aa24.52■■□□□ 1.52
PPOX-201ENST00000352210 KIF21BO75037 1637 aa24.52■■□□□ 1.52
PPOX-201ENST00000352210 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.51■■□□□ 1.51
PPOX-201ENST00000352210 WDR62O43379 1518 aa24.49■■□□□ 1.51
PPOX-201ENST00000352210 CEP162Q5TB80 1403 aa24.43■■□□□ 1.5
PPOX-201ENST00000352210 CUX2O14529 1486 aa24.42■■□□□ 1.5
PPOX-201ENST00000352210 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.4■■□□□ 1.5
PPOX-201ENST00000352210 TOPBP1Q92547 1522 aa24.4■■□□□ 1.5
PPOX-201ENST00000352210 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.37■■□□□ 1.49
PPOX-201ENST00000352210 CUX1P39880 1505 aa24.36■■□□□ 1.49
PPOX-201ENST00000352210 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PPOX-201ENST00000352210 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.29■■□□□ 1.48
PPOX-201ENST00000352210 KIF27Q86VH2 1401 aa24.27■■□□□ 1.48
PPOX-201ENST00000352210 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PPOX-201ENST00000352210 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.22■■□□□ 1.47
PPOX-201ENST00000352210 PRXQ9BXM0 1461 aa24.21■■□□□ 1.47
PPOX-201ENST00000352210 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PPOX-201ENST00000352210 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.15■■□□□ 1.46
PPOX-201ENST00000352210 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.15■■□□□ 1.46
PPOX-201ENST00000352210 CLIP1P30622 1438 aa24.14■■□□□ 1.46
PPOX-201ENST00000352210 IFT140Q96RY7 1462 aa24.13■■□□□ 1.45
PPOX-201ENST00000352210 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PPOX-201ENST00000352210 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PPOX-201ENST00000352210 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.04■■□□□ 1.44
PPOX-201ENST00000352210 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PPOX-201ENST00000352210 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.431e-7■■■■■ 28.1
PPOX-201ENST00000352210 WDR97A6NE52 1622 aa23.97■■□□□ 1.43
PPOX-201ENST00000352210 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.97■■□□□ 1.43
PPOX-201ENST00000352210 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PPOX-201ENST00000352210 IGF1RP08069 1367 aa23.93■■□□□ 1.42
PPOX-201ENST00000352210 APLP2Q06481 763 aa23.89■■□□□ 1.41
PPOX-201ENST00000352210 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.85■■□□□ 1.41
PPOX-201ENST00000352210 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.84■■□□□ 1.41
PPOX-201ENST00000352210 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PPOX-201ENST00000352210 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.83■■□□□ 1.41
PPOX-201ENST00000352210 GRIN2BQ13224 1484 aa23.78■■□□□ 1.4
PPOX-201ENST00000352210 ARAP1Q96P48 1450 aa23.77■■□□□ 1.4
PPOX-201ENST00000352210 CUL7Q14999 1698 aa23.77■■□□□ 1.4
PPOX-201ENST00000352210 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms