Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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