Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 SNX5-205ENST00000463050 845 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SNX5-211ENST00000483485 3087 ntTSL 27.06□□□□□ -1.282e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SNX5-215ENST00000491090 819 ntTSL 36.15□□□□□ -1.422e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 USP22-210ENST00000582335 306 ntTSL 56.11□□□□□ -1.432e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SNX5-209ENST00000476648 950 ntTSL 35.54□□□□□ -1.522e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 TCOF1-208ENST00000506063 526 ntTSL 44.38□□□□□ -1.712e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.722e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 AES-211ENST00000592330 275 ntTSL 54.2□□□□□ -1.742e-7■■■□□ 17
PUM1Q14671 SRRM1-207ENST00000468822 768 ntTSL 217.19■□□□□ 0.344e-11■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 SRRM1-219ENST00000495561 563 ntTSL 27.21□□□□□ -1.264e-11■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 SRRM1-218ENST00000494934 802 ntTSL 35.96□□□□□ -1.464e-11■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 WDR70-207ENST00000511906 5716 ntTSL 25.64□□□□□ -1.513e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 DCTN2-205ENST00000546758 817 ntTSL 56.58□□□□□ -1.363e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 CHD4-213ENST00000545584 553 ntTSL 421.05■□□□□ 0.962e-10■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AATF-202ENST00000613840 648 ntTSL 220.34■□□□□ 0.855e-16■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 XPA-202ENST00000462523 1584 ntTSL 518.64■□□□□ 0.582e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.415e-16■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 413.19□□□□□ -0.34e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 CFDP1-205ENST00000565646 608 ntTSL 312.94□□□□□ -0.344e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 CFDP1-207ENST00000566901 1167 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.444e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 CFDP1-203ENST00000564286 775 ntTSL 511.92□□□□□ -0.54e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.564e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 ATP2A2-207ENST00000548169 2951 ntTSL 28.69□□□□□ -1.024e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 EIF3B-209ENST00000468250 602 ntTSL 28.3□□□□□ -1.082e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 EIF3B-205ENST00000463026 633 ntTSL 27.76□□□□□ -1.172e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 MCM4-213ENST00000521261 1342 ntTSL 25.17□□□□□ -1.582e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 EIF3B-206ENST00000463229 552 ntTSL 54.66□□□□□ -1.662e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 XPA-203ENST00000485042 706 ntTSL 34.61□□□□□ -1.672e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.882e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.49□□□□□ -2.012e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.172e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-28■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.012e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.582e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.572e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.532e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.452e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.392e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.152e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 TMEM259-204ENST00000586285 626 ntTSL 311.89□□□□□ -0.519e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.815e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.143e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.73e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.133e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.233e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.673e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-221ENST00000511637 5999 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.813e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.93e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.375e-10■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 SERF2-208ENST00000409617 700 ntTSL 214.66□□□□□ -0.065e-10■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HYPK-204ENST00000497142 428 ntTSL 213.61□□□□□ -0.235e-10■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 SERF2-213ENST00000448830 2792 ntTSL 212.75□□□□□ -0.375e-10■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.485e-10■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 HYPK-203ENST00000458412 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.55e-10■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 ATAD3B-202ENST00000378736 414 ntTSL 511.33□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.048e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 218.78■□□□□ 0.68e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.468e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.159e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 210.66□□□□□ -0.79e-7■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 MRFAP1L1-202ENST00000500563 2127 nt13.58□□□□□ -0.234e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.414e-6■■■□□ 16.9
PUM1Q14671 CHAF1A-202ENST00000585371 884 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-8■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 CHAF1A-206ENST00000587739 875 ntTSL 59.78□□□□□ -0.842e-8■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.118e-7■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RNF220-213ENST00000480686 3835 ntTSL 212.15□□□□□ -0.461e-7■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RNF220-211ENST00000474956 3303 ntTSL 211.77□□□□□ -0.521e-7■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 219.39■□□□□ 0.692e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 319.39■□□□□ 0.692e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.662e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 518.17■□□□□ 0.52e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 317.93■□□□□ 0.462e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 317.5■□□□□ 0.392e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.542e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 211.44□□□□□ -0.582e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-216ENST00000582935 469 ntTSL 211.44□□□□□ -0.582e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 511.44□□□□□ -0.582e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.852e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.982e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-213ENST00000581741 596 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.292e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 57□□□□□ -1.292e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.2□□□□□ -1.422e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 RPL17-219ENST00000584364 523 ntTSL 25.08□□□□□ -1.62e-21■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 ATP5E-202ENST00000395659 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.788e-10■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.18e-10■■■□□ 16.8
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 97.3 ms