Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 CTNNA1-230ENST00000521724 2741 ntTSL 212.4□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.411e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.961e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.661e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.061e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 226.84■■□□□ 1.891e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.821e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.679e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 NETO2-201ENST00000303155 3241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.199e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-201ENST00000239117 555 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.021e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 512.65□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 NETO2-205ENST00000564667 799 ntTSL 410.6□□□□□ -0.719e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 NETO2-203ENST00000562559 1327 ntTSL 310.29□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 NETO2-204ENST00000563078 581 ntTSL 38.64□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-217ENST00000624668 583 ntTSL 525.06■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-215ENST00000624193 463 ntTSL 424.94■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-211ENST00000623321 1860 ntTSL 1 (best)22.21■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-208ENST00000622960 628 ntTSL 520.65■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-213ENST00000624032 3071 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)5.08□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 DGCR2-202ENST00000389262 4814 ntTSL 1 (best)18.66■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 541.29■■■■■ 4.28e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM2-226ENST00000576415 461 ntTSL 240.29■■■■■ 4.048e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM2-223ENST00000575701 860 ntTSL 339.67■■■■□ 3.948e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.368e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)28.6■■■□□ 2.178e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM2-219ENST00000574340 579 ntTSL 327.59■■■□□ 2.018e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM2-230ENST00000576924 3314 ntTSL 1 (best)22.89■■□□□ 1.258e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.858e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.78e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.63e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.243e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 PDK1-209ENST00000466437 599 ntTSL 413.2□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 ASXL1-205ENST00000497249 296 ntTSL 53.09□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.097e-7■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 MATR3-224ENST00000514488 564 ntTSL 414.12□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 MATR3-205ENST00000503340 696 ntTSL 313.39□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 DYRK1A-204ENST00000398960 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-205ENST00000504789 570 ntTSL 431.13■■■□□ 2.571e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-213ENST00000515355 771 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-209ENST00000511615 1658 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.261e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.451e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-204ENST00000504016 509 ntTSL 35.12□□□□□ -1.591e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.61e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-208ENST00000511175 636 ntTSL 23.98□□□□□ -1.771e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-212ENST00000513013 493 ntTSL 53.8□□□□□ -1.81e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SUB1-202ENST00000502453 4273 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.851e-10■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 ESYT2-205ENST00000497111 663 ntTSL 424.05■■□□□ 1.448e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-217ENST00000553139 902 ntTSL 335.61■■■■□ 3.294e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-212ENST00000550628 561 ntTSL 431.87■■■□□ 2.694e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-210ENST00000549570 732 ntTSL 329.48■■■□□ 2.314e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-211ENST00000549646 588 ntTSL 529.48■■■□□ 2.314e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-205ENST00000547540 2583 ntTSL 1 (best)24.12■■□□□ 1.454e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 32.4
HNRNPMP52272 SRRM1-222ENST00000596378 2314 ntTSL 1 (best)31.85■■■□□ 2.691e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 HGS-214ENST00000576087 548 ntTSL 424.24■■□□□ 1.471e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 NCAPG2-209ENST00000475918 557 ntTSL 419.36■□□□□ 0.691e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 SRRM1-204ENST00000461768 496 ntTSL 313.08□□□□□ -0.321e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 SRRM1-220ENST00000496882 834 ntTSL 512.4□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 SRRM1-214ENST00000485541 679 ntTSL 511.29□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 SRRM1-212ENST00000479034 2671 ntTSL 510.98□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.221e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.471e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 SRRM1-215ENST00000488317 333 ntTSL 25.38□□□□□ -1.551e-9■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 PDE3B-205ENST00000534317 5521 ntTSL 1 (best)23.43■■□□□ 1.346e-7■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 513.42□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 32.3
HNRNPMP52272 LEMD3-203ENST00000541171 856 ntTSL 238.75■■■■□ 3.793e-8■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 AKT2-208ENST00000416994 904 ntTSL 429.37■■■□□ 2.294e-7■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 AKT2-227ENST00000498350 562 ntTSL 422.59■■□□□ 1.214e-7■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.351e-6■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 C7orf73-203ENST00000509448 581 ntTSL 427.97■■■□□ 2.072e-9■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.962e-9■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 ZBTB1-204ENST00000555321 629 ntTSL 427.15■■□□□ 1.942e-9■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 ST3GAL2-203ENST00000561708 581 ntTSL 427.04■■□□□ 1.922e-9■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 ZBTB1-202ENST00000553583 582 ntTSL 324.36■■□□□ 1.492e-9■■■■■ 32.2
HNRNPMP52272 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-9■■■■■ 32.2
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 212.4 ms