Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms