RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.34■■■□□ 2.45
ITGA3-202ENST00000320031 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.16■■■□□ 2.26
ITGA3-202ENST00000320031 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
ITGA3-202ENST00000320031 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.75■■■□□ 2.03
ITGA3-202ENST00000320031 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.28■■□□□ 1.8
ITGA3-202ENST00000320031 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
ITGA3-202ENST00000320031 TRIM41Q8WV44 630 aa25.99■■□□□ 1.75
ITGA3-202ENST00000320031 APLP2Q06481 763 aa25.92■■□□□ 1.74
ITGA3-202ENST00000320031 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.62■■□□□ 1.69
ITGA3-202ENST00000320031 ABCC9O60706 1549 aa25.57■■□□□ 1.68
ITGA3-202ENST00000320031 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
ITGA3-202ENST00000320031 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.4■■□□□ 1.66
ITGA3-202ENST00000320031 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.3■■□□□ 1.64
ITGA3-202ENST00000320031 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ITGA3-202ENST00000320031 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ITGA3-202ENST00000320031 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ITGA3-202ENST00000320031 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ITGA3-202ENST00000320031 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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ITGA3-202ENST00000320031 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.98■■□□□ 1.59
ITGA3-202ENST00000320031 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ITGA3-202ENST00000320031 HRCP23327 699 aa24.84■■□□□ 1.57
ITGA3-202ENST00000320031 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ITGA3-202ENST00000320031 SCRIBQ14160 1630 aa24.74■■□□□ 1.55
ITGA3-202ENST00000320031 MYT1Q01538 1121 aa24.61■■□□□ 1.53
ITGA3-202ENST00000320031 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
ITGA3-202ENST00000320031 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.38■■□□□ 1.49
ITGA3-202ENST00000320031 NACADO15069 1562 aa24.34■■□□□ 1.49
ITGA3-202ENST00000320031 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.33■■□□□ 1.48
ITGA3-202ENST00000320031 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ITGA3-202ENST00000320031 ITGAEP38570 1179 aa24.3■■□□□ 1.48
ITGA3-202ENST00000320031 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ITGA3-202ENST00000320031 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.22■■□□□ 1.47
ITGA3-202ENST00000320031 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ITGA3-202ENST00000320031 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ITGA3-202ENST00000320031 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ITGA3-202ENST00000320031 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.86■■□□□ 1.41
ITGA3-202ENST00000320031 NEFLP07196 543 aa23.85■■□□□ 1.41
ITGA3-202ENST00000320031 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
ITGA3-202ENST00000320031 FBLN2P98095 1184 aa23.72■■□□□ 1.39
ITGA3-202ENST00000320031 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.7■■□□□ 1.39
ITGA3-202ENST00000320031 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
ITGA3-202ENST00000320031 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
ITGA3-202ENST00000320031 P3H3Q8IVL6 736 aa23.67■■□□□ 1.38
ITGA3-202ENST00000320031 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.67■■□□□ 1.38
ITGA3-202ENST00000320031 EEA1Q15075 1411 aa23.66■■□□□ 1.38
ITGA3-202ENST00000320031 TRIM52Q96A61 297 aa23.64■■□□□ 1.37
ITGA3-202ENST00000320031 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.6■■□□□ 1.37
ITGA3-202ENST00000320031 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
ITGA3-202ENST00000320031 NEUROD1Q13562 356 aa23.53■■□□□ 1.36
ITGA3-202ENST00000320031 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.52■■□□□ 1.36
ITGA3-202ENST00000320031 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA3Q08378 1498 aa23.45■■□□□ 1.34
ITGA3-202ENST00000320031 CLIP1P30622 1438 aa23.44■■□□□ 1.34
ITGA3-202ENST00000320031 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.44■■□□□ 1.34
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
ITGA3-202ENST00000320031 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.39■■□□□ 1.33
ITGA3-202ENST00000320031 ARID3CA6NKF2 412 aa23.37■■□□□ 1.33
ITGA3-202ENST00000320031 CEP162Q5TB80 1403 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGA3-202ENST00000320031 KIF27Q86VH2 1401 aa23.31■■□□□ 1.32
ITGA3-202ENST00000320031 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.31■■□□□ 1.32
ITGA3-202ENST00000320031 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGA3-202ENST00000320031 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-202ENST00000320031 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.24■■□□□ 1.31
ITGA3-202ENST00000320031 SMARCA2P51531 1590 aa23.23■■□□□ 1.31
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ITGA3-202ENST00000320031 ANP32CO43423 234 aa23.18■■□□□ 1.3
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-202ENST00000320031 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.15■■□□□ 1.3
ITGA3-202ENST00000320031 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
ITGA3-202ENST00000320031 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ITGA3-202ENST00000320031 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ITGA3-202ENST00000320031 WIZO95785 1651 aa23.09■■□□□ 1.29
ITGA3-202ENST00000320031 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ITGA3-202ENST00000320031 TONSLQ96HA7 1378 aa23.06■■□□□ 1.28
ITGA3-202ENST00000320031 SOGA1O94964 1423 aa23.05■■□□□ 1.28
ITGA3-202ENST00000320031 ABCC8Q09428 1581 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA3-202ENST00000320031 SMARCA4P51532 1647 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGA3-202ENST00000320031 CUX2O14529 1486 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-202ENST00000320031 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.94■■□□□ 1.26
ITGA3-202ENST00000320031 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
ITGA3-202ENST00000320031 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-202ENST00000320031 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.91■■□□□ 1.26
ITGA3-202ENST00000320031 TSPY4P0CV99 314 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA3-202ENST00000320031 TSPY10P0CW01 314 aa22.89■■□□□ 1.25
ITGA3-202ENST00000320031 ERCC6Q03468 1493 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGA3-202ENST00000320031 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.83■■□□□ 1.25
ITGA3-202ENST00000320031 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-202ENST00000320031 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ITGA3-202ENST00000320031 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.77■■□□□ 1.24
ITGA3-202ENST00000320031 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.76■■□□□ 1.23
ITGA3-202ENST00000320031 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.71■■□□□ 1.23
ITGA3-202ENST00000320031 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ITGA3-202ENST00000320031 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
ITGA3-202ENST00000320031 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.65■■□□□ 1.22
ITGA3-202ENST00000320031 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.65■■□□□ 1.22
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