RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519751.5

MSC-AS1-206, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 596 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-206ENST00000519751 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.89■■■■□ 3.82
MSC-AS1-206ENST00000519751 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.67■■■■□ 3.14
MSC-AS1-206ENST00000519751 ABCC9O60706 1549 aa34.16■■■■□ 3.06
MSC-AS1-206ENST00000519751 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.8■■■□□ 2.84
MSC-AS1-206ENST00000519751 NACADO15069 1562 aa32.72■■■□□ 2.83
MSC-AS1-206ENST00000519751 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.69■■■□□ 2.82
MSC-AS1-206ENST00000519751 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.46■■■□□ 2.79
MSC-AS1-206ENST00000519751 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
MSC-AS1-206ENST00000519751 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.21■■■□□ 2.75
MSC-AS1-206ENST00000519751 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.91■■■□□ 2.7
MSC-AS1-206ENST00000519751 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.85■■■□□ 2.69
MSC-AS1-206ENST00000519751 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.7■■■□□ 2.67
MSC-AS1-206ENST00000519751 SCRIBQ14160 1630 aa31.58■■■□□ 2.65
MSC-AS1-206ENST00000519751 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.53■■■□□ 2.64
MSC-AS1-206ENST00000519751 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.53■■■□□ 2.64
MSC-AS1-206ENST00000519751 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
MSC-AS1-206ENST00000519751 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.87■■■□□ 2.53
MSC-AS1-206ENST00000519751 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.76■■■□□ 2.52
MSC-AS1-206ENST00000519751 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
MSC-AS1-206ENST00000519751 SMARCA4P51532 1647 aa30.2■■■□□ 2.43
MSC-AS1-206ENST00000519751 NCAPD3P42695 1498 aa30.19■■■□□ 2.42
MSC-AS1-206ENST00000519751 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.14■■■□□ 2.42
MSC-AS1-206ENST00000519751 SMARCA2P51531 1590 aa30.14■■■□□ 2.42
MSC-AS1-206ENST00000519751 HMGXB3Q12766 1538 aa30■■■□□ 2.39
MSC-AS1-206ENST00000519751 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.94■■■□□ 2.38
MSC-AS1-206ENST00000519751 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.93■■■□□ 2.38
MSC-AS1-206ENST00000519751 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
MSC-AS1-206ENST00000519751 WIZO95785 1651 aa29.56■■■□□ 2.32
MSC-AS1-206ENST00000519751 ERCC6Q03468 1493 aa29.55■■■□□ 2.32
MSC-AS1-206ENST00000519751 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
MSC-AS1-206ENST00000519751 NESP48681 1621 aa29.45■■■□□ 2.3
MSC-AS1-206ENST00000519751 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.43■■■□□ 2.3
MSC-AS1-206ENST00000519751 CUX2O14529 1486 aa29.32■■■□□ 2.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.32■■■□□ 2.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.31■■■□□ 2.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 CFTRP13569 1480 aa29.07■■■□□ 2.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.05■■■□□ 2.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.96■■■□□ 2.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.96■■■□□ 2.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.96■■■□□ 2.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.96■■■□□ 2.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 WDR62O43379 1518 aa28.84■■■□□ 2.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.71■■■□□ 2.19
MSC-AS1-206ENST00000519751 PRDM2Q13029 1718 aa28.7■■■□□ 2.19
MSC-AS1-206ENST00000519751 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
MSC-AS1-206ENST00000519751 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
MSC-AS1-206ENST00000519751 ABCC8Q09428 1581 aa28.53■■■□□ 2.16
MSC-AS1-206ENST00000519751 TOPBP1Q92547 1522 aa28.44■■■□□ 2.14
MSC-AS1-206ENST00000519751 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.39■■■□□ 2.14
MSC-AS1-206ENST00000519751 IFT140Q96RY7 1462 aa28.38■■■□□ 2.13
MSC-AS1-206ENST00000519751 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
MSC-AS1-206ENST00000519751 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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MSC-AS1-206ENST00000519751 OSCARQ8IYS5 282 aa28.11■■■□□ 2.09
MSC-AS1-206ENST00000519751 CUX1P39880 1505 aa28.1■■■□□ 2.09
MSC-AS1-206ENST00000519751 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
MSC-AS1-206ENST00000519751 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.08■■■□□ 2.09
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MSC-AS1-206ENST00000519751 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.03■■■□□ 2.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 WDR97A6NE52 1622 aa27.96■■■□□ 2.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
MSC-AS1-206ENST00000519751 FBLN2P98095 1184 aa27.82■■■□□ 2.04
MSC-AS1-206ENST00000519751 GRIN2BQ13224 1484 aa27.82■■■□□ 2.04
MSC-AS1-206ENST00000519751 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.82■■■□□ 2.04
MSC-AS1-206ENST00000519751 TOP2BQ02880 1626 aa27.81■■■□□ 2.04
MSC-AS1-206ENST00000519751 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.78■■■□□ 2.04
MSC-AS1-206ENST00000519751 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.77■■■□□ 2.04
MSC-AS1-206ENST00000519751 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
MSC-AS1-206ENST00000519751 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.76■■■□□ 2.04
MSC-AS1-206ENST00000519751 SYNJ1O43426 1573 aa27.74■■■□□ 2.03
MSC-AS1-206ENST00000519751 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
MSC-AS1-206ENST00000519751 CHD1O14646 1710 aa27.69■■■□□ 2.02
MSC-AS1-206ENST00000519751 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.67■■■□□ 2.02
MSC-AS1-206ENST00000519751 SYNJ2O15056 1496 aa27.66■■■□□ 2.02
MSC-AS1-206ENST00000519751 TRIM41Q8WV44 630 aa27.65■■■□□ 2.02
MSC-AS1-206ENST00000519751 PBRM1Q86U86 1689 aa27.61■■■□□ 2.01
MSC-AS1-206ENST00000519751 ARHGEF11O15085 1522 aa27.55■■■□□ 2
MSC-AS1-206ENST00000519751 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.53■■■□□ 2
MSC-AS1-206ENST00000519751 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.53■■■□□ 2
MSC-AS1-206ENST00000519751 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.53■■■□□ 2
MSC-AS1-206ENST00000519751 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.49■■□□□ 1.99
MSC-AS1-206ENST00000519751 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.47■■□□□ 1.99
MSC-AS1-206ENST00000519751 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.45■■□□□ 1.98
MSC-AS1-206ENST00000519751 ADAMTS12P58397 1594 aa27.43■■□□□ 1.98
MSC-AS1-206ENST00000519751 GRIN2AQ12879 1464 aa27.43■■□□□ 1.98
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIF27Q86VH2 1401 aa27.39■■□□□ 1.97
MSC-AS1-206ENST00000519751 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.37■■□□□ 1.97
MSC-AS1-206ENST00000519751 NUP160Q12769 1436 aa27.32■■□□□ 1.96
MSC-AS1-206ENST00000519751 ARAP1Q96P48 1450 aa27.29■■□□□ 1.96
MSC-AS1-206ENST00000519751 IGF1RP08069 1367 aa27.25■■□□□ 1.95
MSC-AS1-206ENST00000519751 CEP170Q5SW79 1584 aa27.23■■□□□ 1.95
MSC-AS1-206ENST00000519751 CUL7Q14999 1698 aa27.17■■□□□ 1.94
MSC-AS1-206ENST00000519751 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.11■■□□□ 1.93
MSC-AS1-206ENST00000519751 JPH4Q96JJ6 628 aa27.09■■□□□ 1.93
MSC-AS1-206ENST00000519751 SHROOM2Q13796 1616 aa27.08■■□□□ 1.93
MSC-AS1-206ENST00000519751 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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