Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TM4SF18Q96CE8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.7 ms