RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326786.4

ETV3-201, Transcript of ETS variant 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ETV3, Length 1,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3-201ENST00000326786 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.93■■■■□ 3.34
ETV3-201ENST00000326786 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.51■■■□□ 2.63
ETV3-201ENST00000326786 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ETV3-201ENST00000326786 ABCC9O60706 1549 aa29.97■■■□□ 2.39
ETV3-201ENST00000326786 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.76■■■□□ 2.36
ETV3-201ENST00000326786 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.62■■■□□ 2.33
ETV3-201ENST00000326786 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.55■■■□□ 2.32
ETV3-201ENST00000326786 NACADO15069 1562 aa29.41■■■□□ 2.3
ETV3-201ENST00000326786 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.2■■■□□ 2.27
ETV3-201ENST00000326786 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.96■■■□□ 2.23
ETV3-201ENST00000326786 SCRIBQ14160 1630 aa28.84■■■□□ 2.21
ETV3-201ENST00000326786 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.6■■■□□ 2.17
ETV3-201ENST00000326786 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.34■■■□□ 2.13
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ETV3-201ENST00000326786 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.91■■■□□ 2.06
ETV3-201ENST00000326786 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.84■■■□□ 2.05
ETV3-201ENST00000326786 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
ETV3-201ENST00000326786 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
ETV3-201ENST00000326786 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.72■■■□□ 2.03
ETV3-201ENST00000326786 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
ETV3-201ENST00000326786 SMARCA4P51532 1647 aa27.68■■■□□ 2.02
ETV3-201ENST00000326786 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ETV3-201ENST00000326786 WIZO95785 1651 aa27.47■■□□□ 1.99
ETV3-201ENST00000326786 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.4■■□□□ 1.98
ETV3-201ENST00000326786 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.3■■□□□ 1.96
ETV3-201ENST00000326786 SMARCA2P51531 1590 aa27.29■■□□□ 1.96
ETV3-201ENST00000326786 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
ETV3-201ENST00000326786 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.15■■□□□ 1.94
ETV3-201ENST00000326786 NCAPD3P42695 1498 aa27.14■■□□□ 1.94
ETV3-201ENST00000326786 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
ETV3-201ENST00000326786 HMGXB3Q12766 1538 aa27.08■■□□□ 1.93
ETV3-201ENST00000326786 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.91■■□□□ 1.9
ETV3-201ENST00000326786 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.44■■□□□ 1.82
ETV3-201ENST00000326786 CFTRP13569 1480 aa26.44■■□□□ 1.82
ETV3-201ENST00000326786 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.4■■□□□ 1.82
ETV3-201ENST00000326786 PRDM2Q13029 1718 aa26.3■■□□□ 1.8
ETV3-201ENST00000326786 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.26■■□□□ 1.79
ETV3-201ENST00000326786 NESP48681 1621 aa26.22■■□□□ 1.79
ETV3-201ENST00000326786 ABCC8Q09428 1581 aa26.21■■□□□ 1.79
ETV3-201ENST00000326786 TRIM41Q8WV44 630 aa26.12■■□□□ 1.77
ETV3-201ENST00000326786 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
ETV3-201ENST00000326786 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.09■■□□□ 1.77
ETV3-201ENST00000326786 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
ETV3-201ENST00000326786 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.04■■□□□ 1.76
ETV3-201ENST00000326786 SYNJ1O43426 1573 aa26.01■■□□□ 1.75
ETV3-201ENST00000326786 TOP2BQ02880 1626 aa25.96■■□□□ 1.75
ETV3-201ENST00000326786 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.95■■□□□ 1.75
ETV3-201ENST00000326786 CUX1P39880 1505 aa25.95■■□□□ 1.74
ETV3-201ENST00000326786 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.94■■□□□ 1.74
ETV3-201ENST00000326786 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.93■■□□□ 1.74
ETV3-201ENST00000326786 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.82■■□□□ 1.72
ETV3-201ENST00000326786 ERCC6Q03468 1493 aa25.8■■□□□ 1.72
ETV3-201ENST00000326786 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ETV3-201ENST00000326786 TOPBP1Q92547 1522 aa25.79■■□□□ 1.72
ETV3-201ENST00000326786 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.73■■□□□ 1.71
ETV3-201ENST00000326786 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.7■■□□□ 1.7
ETV3-201ENST00000326786 SOGA1O94964 1423 aa25.67■■□□□ 1.7
ETV3-201ENST00000326786 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
ETV3-201ENST00000326786 WDR62O43379 1518 aa25.63■■□□□ 1.69
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ETV3-201ENST00000326786 EEA1Q15075 1411 aa25.6■■□□□ 1.69
ETV3-201ENST00000326786 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.58■■□□□ 1.69
ETV3-201ENST00000326786 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
ETV3-201ENST00000326786 CUX2O14529 1486 aa25.53■■□□□ 1.68
ETV3-201ENST00000326786 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.52■■□□□ 1.68
ETV3-201ENST00000326786 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.5■■□□□ 1.67
ETV3-201ENST00000326786 KIF27Q86VH2 1401 aa25.48■■□□□ 1.67
ETV3-201ENST00000326786 WDR97A6NE52 1622 aa25.45■■□□□ 1.67
ETV3-201ENST00000326786 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.45■■□□□ 1.66
ETV3-201ENST00000326786 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
ETV3-201ENST00000326786 IFT140Q96RY7 1462 aa25.38■■□□□ 1.65
ETV3-201ENST00000326786 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.37■■□□□ 1.65
ETV3-201ENST00000326786 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.31■■□□□ 1.64
ETV3-201ENST00000326786 IGF1RP08069 1367 aa25.3■■□□□ 1.64
ETV3-201ENST00000326786 KIF21BO75037 1637 aa25.28■■□□□ 1.64
ETV3-201ENST00000326786 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ETV3-201ENST00000326786 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.27■■□□□ 1.64
ETV3-201ENST00000326786 PRXQ9BXM0 1461 aa25.26■■□□□ 1.63
ETV3-201ENST00000326786 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.25■■□□□ 1.63
ETV3-201ENST00000326786 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ETV3-201ENST00000326786 GOLGA3Q08378 1498 aa25.21■■□□□ 1.63
ETV3-201ENST00000326786 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.2■■□□□ 1.62
ETV3-201ENST00000326786 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.622e-6■■■■■ 28.4
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ETV3-201ENST00000326786 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.16■■□□□ 1.62
ETV3-201ENST00000326786 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.15■■□□□ 1.62
ETV3-201ENST00000326786 CUL7Q14999 1698 aa25.14■■□□□ 1.61
ETV3-201ENST00000326786 PBRM1Q86U86 1689 aa25.14■■□□□ 1.61
ETV3-201ENST00000326786 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ETV3-201ENST00000326786 GRIN2BQ13224 1484 aa25.11■■□□□ 1.61
ETV3-201ENST00000326786 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.08■■□□□ 1.61
ETV3-201ENST00000326786 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ETV3-201ENST00000326786 ADAMTS12P58397 1594 aa24.99■■□□□ 1.59
ETV3-201ENST00000326786 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.99■■□□□ 1.59
ETV3-201ENST00000326786 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.96■■□□□ 1.59
ETV3-201ENST00000326786 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
ETV3-201ENST00000326786 CEP162Q5TB80 1403 aa24.9■■□□□ 1.58
ETV3-201ENST00000326786 SYNJ2O15056 1496 aa24.85■■□□□ 1.57
ETV3-201ENST00000326786 GRIN2AQ12879 1464 aa24.8■■□□□ 1.56
ETV3-201ENST00000326786 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.8■■□□□ 1.56
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