Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ABCF2Q9UG63 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms