RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515200.5

GRAMD2B-217, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD2B, Length 3,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-217ENST00000515200 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.27■■■□□ 2.92
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GRAMD2B-217ENST00000515200 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.11■■■□□ 2.25
GRAMD2B-217ENST00000515200 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GRAMD2B-217ENST00000515200 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.9■■■□□ 2.06
GRAMD2B-217ENST00000515200 ABCC9O60706 1549 aa27.27■■□□□ 1.96
GRAMD2B-217ENST00000515200 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.15■■□□□ 1.94
GRAMD2B-217ENST00000515200 SCRIBQ14160 1630 aa27■■□□□ 1.91
GRAMD2B-217ENST00000515200 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.99■■□□□ 1.91
GRAMD2B-217ENST00000515200 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.94■■□□□ 1.9
GRAMD2B-217ENST00000515200 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.82■■□□□ 1.88
GRAMD2B-217ENST00000515200 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.73■■□□□ 1.87
GRAMD2B-217ENST00000515200 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
GRAMD2B-217ENST00000515200 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.46■■□□□ 1.83
GRAMD2B-217ENST00000515200 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GRAMD2B-217ENST00000515200 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.42■■□□□ 1.82
GRAMD2B-217ENST00000515200 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
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GRAMD2B-217ENST00000515200 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.2■■□□□ 1.78
GRAMD2B-217ENST00000515200 HRCP23327 699 aa26.15■■□□□ 1.78
GRAMD2B-217ENST00000515200 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD2B-217ENST00000515200 NACADO15069 1562 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD2B-217ENST00000515200 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
GRAMD2B-217ENST00000515200 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
GRAMD2B-217ENST00000515200 WIZO95785 1651 aa25.97■■□□□ 1.75
GRAMD2B-217ENST00000515200 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
GRAMD2B-217ENST00000515200 ABCC8Q09428 1581 aa25.52■■□□□ 1.68
GRAMD2B-217ENST00000515200 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
GRAMD2B-217ENST00000515200 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.5■■□□□ 1.67
GRAMD2B-217ENST00000515200 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
GRAMD2B-217ENST00000515200 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
GRAMD2B-217ENST00000515200 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.42■■□□□ 1.66
GRAMD2B-217ENST00000515200 SMARCA4P51532 1647 aa25.37■■□□□ 1.65
GRAMD2B-217ENST00000515200 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
GRAMD2B-217ENST00000515200 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
GRAMD2B-217ENST00000515200 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD2B-217ENST00000515200 SOGA1O94964 1423 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD2B-217ENST00000515200 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GRAMD2B-217ENST00000515200 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.19■■□□□ 1.62
GRAMD2B-217ENST00000515200 SMARCA2P51531 1590 aa25.18■■□□□ 1.62
GRAMD2B-217ENST00000515200 MYT1Q01538 1121 aa25.12■■□□□ 1.61
GRAMD2B-217ENST00000515200 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GRAMD2B-217ENST00000515200 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.01■■□□□ 1.59
GRAMD2B-217ENST00000515200 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
GRAMD2B-217ENST00000515200 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GRAMD2B-217ENST00000515200 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD2B-217ENST00000515200 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
GRAMD2B-217ENST00000515200 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
GRAMD2B-217ENST00000515200 CEP162Q5TB80 1403 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD2B-217ENST00000515200 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GRAMD2B-217ENST00000515200 SYNJ1O43426 1573 aa24.72■■□□□ 1.55
GRAMD2B-217ENST00000515200 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD2B-217ENST00000515200 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD2B-217ENST00000515200 GOLGA3Q08378 1498 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD2B-217ENST00000515200 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD2B-217ENST00000515200 APLP2Q06481 763 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GRAMD2B-217ENST00000515200 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD2B-217ENST00000515200 CLIP1P30622 1438 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD2B-217ENST00000515200 NEUROD1Q13562 356 aa24.44■■□□□ 1.5
GRAMD2B-217ENST00000515200 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD2B-217ENST00000515200 ITGAEP38570 1179 aa24.41■■□□□ 1.5
GRAMD2B-217ENST00000515200 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
GRAMD2B-217ENST00000515200 P3H3Q8IVL6 736 aa24.39■■□□□ 1.5
GRAMD2B-217ENST00000515200 EEA1Q15075 1411 aa24.36■■□□□ 1.49
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GRAMD2B-217ENST00000515200 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD2B-217ENST00000515200 NCAPD3P42695 1498 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD2B-217ENST00000515200 CUX1P39880 1505 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD2B-217ENST00000515200 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD2B-217ENST00000515200 TOP2BQ02880 1626 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD2B-217ENST00000515200 NESP48681 1621 aa24.15■■□□□ 1.46
GRAMD2B-217ENST00000515200 CUX2O14529 1486 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD2B-217ENST00000515200 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.11■■□□□ 1.45
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GRAMD2B-217ENST00000515200 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD2B-217ENST00000515200 KIF27Q86VH2 1401 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD2B-217ENST00000515200 HMGXB3Q12766 1538 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD2B-217ENST00000515200 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.08■■□□□ 1.44
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GRAMD2B-217ENST00000515200 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD2B-217ENST00000515200 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD2B-217ENST00000515200 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.9■■□□□ 1.42
GRAMD2B-217ENST00000515200 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
GRAMD2B-217ENST00000515200 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GRAMD2B-217ENST00000515200 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GRAMD2B-217ENST00000515200 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.81■■□□□ 1.4
GRAMD2B-217ENST00000515200 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
GRAMD2B-217ENST00000515200 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.73■■□□□ 1.39
GRAMD2B-217ENST00000515200 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.69■■□□□ 1.38
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