Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.659e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SLC35E1-201ENST00000409648 3691 ntTSL 28.43□□□□□ -1.069e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CAPN2-209ENST00000487223 2991 ntTSL 27.65□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SLC35E1-207ENST00000593812 924 ntTSL 56.67□□□□□ -1.349e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SLC35E1-209ENST00000596387 446 ntTSL 56.12□□□□□ -1.439e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CAPN2-204ENST00000463997 2547 ntTSL 25.49□□□□□ -1.531e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CAPN2-206ENST00000474026 4130 ntTSL 25.29□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATIC-207ENST00000443953 2187 ntTSL 222.55■■□□□ 1.22e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 12e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATIC-203ENST00000426233 713 ntTSL 27.22□□□□□ -1.252e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATIC-213ENST00000479093 772 ntTSL 27.15□□□□□ -1.262e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RPL13A-206ENST00000476268 1623 ntTSL 320.14■□□□□ 0.815e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.052e-12■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RDH11-204ENST00000553578 4035 ntTSL 1 (best)4.32□□□□□ -1.722e-12■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.774e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.854e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.474e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.754e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.774e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.672e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 WAC-210ENST00000439676 2762 ntTSL 55.23□□□□□ -1.572e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.461e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.014e-21■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.966e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.736e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.146e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.046e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.296e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.494e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-218ENST00000488813 1641 ntTSL 211.47□□□□□ -0.574e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 310.17□□□□□ -0.784e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SRP14-207ENST00000559475 463 ntTSL 210.15□□□□□ -0.786e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 29.8□□□□□ -0.844e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-219ENST00000490251 2135 ntTSL 29.77□□□□□ -0.854e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.94e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 28.84□□□□□ -0.994e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 28.71□□□□□ -1.024e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SRP14-206ENST00000559439 743 ntTSL 37.99□□□□□ -1.136e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 GMPS-202ENST00000476145 570 ntTSL 45.91□□□□□ -1.466e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.474e-23■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-207ENST00000585828 2139 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.342e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-214ENST00000587797 1878 ntTSL 216.5■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-225ENST00000592831 4652 nt11.4□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-11■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.571e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ABCA7-215ENST00000531478 725 ntTSL 323.99■■□□□ 1.432e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ABCA7-206ENST00000525073 1918 ntTSL 223.45■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.291e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.251e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 TCF3-207ENST00000586164 409 ntTSL 321.68■■□□□ 1.062e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.031e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.561e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.52e-13■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-203ENST00000477244 696 ntTSL 314.05□□□□□ -0.161e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-207ENST00000595072 721 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.271e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-210ENST00000597868 927 ntTSL 312.89□□□□□ -0.351e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PRKAG1-216ENST00000551770 1015 ntTSL 311.66□□□□□ -0.542e-13■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CALM3-204ENST00000482455 650 ntTSL 49.69□□□□□ -0.861e-25■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.961e-8■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.397e-17■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.197e-17■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.297e-17■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.172e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 GORASP2-202ENST00000442798 1976 ntTSL 216.27■□□□□ 0.29e-15■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 GORASP2-207ENST00000486498 2096 ntTSL 215.41■□□□□ 0.069e-15■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.741e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.661e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 KDM1A-206ENST00000602503 2810 nt8.61□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.043e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PBK-204ENST00000524266 819 ntTSL 58.61□□□□□ -1.033e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 RACK1-203ENST00000502844 1460 ntTSL 317.41■□□□□ 0.381e-60■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.893e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.883e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 LMO2-203ENST00000411482 1519 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.013e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 LMO2-204ENST00000464025 1550 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.693e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 216.8■□□□□ 0.283e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 HNRNPH3-210ENST00000490442 1521 ntTSL 216.8■□□□□ 0.283e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 NDUFS8-209ENST00000526542 372 ntTSL 310.68□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SUCLG1-206ENST00000487809 762 ntTSL 27.51□□□□□ -1.216e-18■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.842e-7■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 IRAK1-201ENST00000369973 2358 ntTSL 526.56■■□□□ 1.841e-11■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 IRAK1-209ENST00000444254 783 ntTSL 521.15■□□□□ 0.981e-11■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 EIF3K-206ENST00000588299 524 ntTSL 210.8□□□□□ -0.681e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.085e-6■□□□□ 10.2
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