RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464025.5

LMO2-204, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO2, Length 1,550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-204ENST00000464025 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.15■■■■□ 3.7
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LMO2-204ENST00000464025 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
LMO2-204ENST00000464025 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.63■■■□□ 2.65
LMO2-204ENST00000464025 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.42■■■□□ 2.62
LMO2-204ENST00000464025 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.12■■■□□ 2.57
LMO2-204ENST00000464025 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.02■■■□□ 2.56
LMO2-204ENST00000464025 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
LMO2-204ENST00000464025 NACADO15069 1562 aa30.56■■■□□ 2.48
LMO2-204ENST00000464025 ABCC9O60706 1549 aa30.48■■■□□ 2.47
LMO2-204ENST00000464025 SCRIBQ14160 1630 aa30.32■■■□□ 2.44
LMO2-204ENST00000464025 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.11■■■□□ 2.41
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LMO2-204ENST00000464025 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.58■■■□□ 2.33
LMO2-204ENST00000464025 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.55■■■□□ 2.32
LMO2-204ENST00000464025 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-204ENST00000464025 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
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LMO2-204ENST00000464025 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.21■■■□□ 2.27
LMO2-204ENST00000464025 SMARCA4P51532 1647 aa29.18■■■□□ 2.26
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LMO2-204ENST00000464025 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.87■■■□□ 2.21
LMO2-204ENST00000464025 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
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LMO2-204ENST00000464025 SMARCA2P51531 1590 aa28.76■■■□□ 2.19
LMO2-204ENST00000464025 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.7■■■□□ 2.19
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LMO2-204ENST00000464025 EEA1Q15075 1411 aa28.05■■■□□ 2.08
LMO2-204ENST00000464025 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
LMO2-204ENST00000464025 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.93■■■□□ 2.06
LMO2-204ENST00000464025 SYNJ1O43426 1573 aa27.9■■■□□ 2.06
LMO2-204ENST00000464025 SOGA1O94964 1423 aa27.89■■■□□ 2.05
LMO2-204ENST00000464025 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
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LMO2-204ENST00000464025 TOP2BQ02880 1626 aa27.78■■■□□ 2.04
LMO2-204ENST00000464025 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.76■■■□□ 2.03
LMO2-204ENST00000464025 CFTRP13569 1480 aa27.75■■■□□ 2.03
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LMO2-204ENST00000464025 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.72■■■□□ 2.03
LMO2-204ENST00000464025 PRDM2Q13029 1718 aa27.7■■■□□ 2.03
LMO2-204ENST00000464025 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.66■■■□□ 2.02
LMO2-204ENST00000464025 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.65■■■□□ 2.02
LMO2-204ENST00000464025 GOLGA3Q08378 1498 aa27.65■■■□□ 2.02
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LMO2-204ENST00000464025 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.58■■■□□ 2.01
LMO2-204ENST00000464025 CEP162Q5TB80 1403 aa27.56■■■□□ 2
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LMO2-204ENST00000464025 KIF27Q86VH2 1401 aa27.28■■□□□ 1.96
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LMO2-204ENST00000464025 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.18■■□□□ 1.94
LMO2-204ENST00000464025 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.13■■□□□ 1.93
LMO2-204ENST00000464025 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
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LMO2-204ENST00000464025 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.08■■□□□ 1.93
LMO2-204ENST00000464025 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
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LMO2-204ENST00000464025 NESP48681 1621 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-204ENST00000464025 TOPBP1Q92547 1522 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-204ENST00000464025 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.92■■□□□ 1.9
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LMO2-204ENST00000464025 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-204ENST00000464025 ARAP1Q96P48 1450 aa26.87■■□□□ 1.89
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LMO2-204ENST00000464025 WDR97A6NE52 1622 aa26.78■■□□□ 1.88
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LMO2-204ENST00000464025 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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LMO2-204ENST00000464025 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.65■■□□□ 1.86
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LMO2-204ENST00000464025 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
LMO2-204ENST00000464025 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
LMO2-204ENST00000464025 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
LMO2-204ENST00000464025 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.54■■□□□ 1.84
LMO2-204ENST00000464025 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.52■■□□□ 1.84
LMO2-204ENST00000464025 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.51■■□□□ 1.83
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LMO2-204ENST00000464025 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.47■■□□□ 1.83
LMO2-204ENST00000464025 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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