Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRT76Q01546 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms