Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZMYND8Q9ULU4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZMYND8Q9ULU4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMYND8Q9ULU4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZMYND8Q9ULU4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms