RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.99■■■■■ 6.39
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PRADC1-201ENST00000258083 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.37■■■■■ 5.01
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PRADC1-201ENST00000258083 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.54■■■■■ 4.88
PRADC1-201ENST00000258083 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.26■■■■■ 4.84
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PRADC1-201ENST00000258083 SCRIBQ14160 1630 aa44.65■■■■■ 4.74
PRADC1-201ENST00000258083 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.58■■■■■ 4.73
PRADC1-201ENST00000258083 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
PRADC1-201ENST00000258083 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.77■■■■■ 4.6
PRADC1-201ENST00000258083 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.57■■■■■ 4.56
PRADC1-201ENST00000258083 NCAPD3P42695 1498 aa42.74■■■■■ 4.43
PRADC1-201ENST00000258083 SMARCA4P51532 1647 aa42.72■■■■■ 4.43
PRADC1-201ENST00000258083 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.67■■■■■ 4.42
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PRADC1-201ENST00000258083 SMARCA2P51531 1590 aa42.55■■■■■ 4.4
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PRADC1-201ENST00000258083 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.39■■■■■ 4.38
PRADC1-201ENST00000258083 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.35■■■■■ 4.37
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PRADC1-201ENST00000258083 NESP48681 1621 aa41.77■■■■■ 4.28
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PRADC1-201ENST00000258083 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.61■■■■■ 4.25
PRADC1-201ENST00000258083 CUX2O14529 1486 aa41.53■■■■■ 4.24
PRADC1-201ENST00000258083 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.44■■■■■ 4.22
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PRADC1-201ENST00000258083 CFTRP13569 1480 aa41.11■■■■■ 4.17
PRADC1-201ENST00000258083 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.95■■■■■ 4.15
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.92■■■■■ 4.14
PRADC1-201ENST00000258083 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.92■■■■■ 4.14
PRADC1-201ENST00000258083 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.9■■■■■ 4.14
PRADC1-201ENST00000258083 WDR62O43379 1518 aa40.86■■■■■ 4.13
PRADC1-201ENST00000258083 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.8■■■■■ 4.12
PRADC1-201ENST00000258083 PRDM2Q13029 1718 aa40.62■■■■■ 4.09
PRADC1-201ENST00000258083 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PRADC1-201ENST00000258083 TOPBP1Q92547 1522 aa40.22■■■■■ 4.03
PRADC1-201ENST00000258083 ABCC8Q09428 1581 aa40.2■■■■■ 4.03
PRADC1-201ENST00000258083 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
PRADC1-201ENST00000258083 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.12■■■■■ 4.01
PRADC1-201ENST00000258083 IFT140Q96RY7 1462 aa40.09■■■■■ 4.01
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PRADC1-201ENST00000258083 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.67■■■■□ 3.94
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PRADC1-201ENST00000258083 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
PRADC1-201ENST00000258083 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.32■■■■□ 3.89
PRADC1-201ENST00000258083 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.31■■■■□ 3.88
PRADC1-201ENST00000258083 TOP2BQ02880 1626 aa39.29■■■■□ 3.88
PRADC1-201ENST00000258083 GRIN2BQ13224 1484 aa39.27■■■■□ 3.88
PRADC1-201ENST00000258083 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.27■■■■□ 3.88
PRADC1-201ENST00000258083 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.26■■■■□ 3.88
PRADC1-201ENST00000258083 CHD1O14646 1710 aa39.26■■■■□ 3.87
PRADC1-201ENST00000258083 SYNJ1O43426 1573 aa39.24■■■■□ 3.87
PRADC1-201ENST00000258083 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
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PRADC1-201ENST00000258083 TRIM41Q8WV44 630 aa39.12■■■■□ 3.85
PRADC1-201ENST00000258083 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.08■■■■□ 3.85
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PRADC1-201ENST00000258083 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.08■■■■□ 3.85
PRADC1-201ENST00000258083 SYNJ2O15056 1496 aa39.08■■■■□ 3.85
PRADC1-201ENST00000258083 PBRM1Q86U86 1689 aa39.07■■■■□ 3.85
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PRADC1-201ENST00000258083 SHROOM2Q13796 1616 aa38.38■■■■□ 3.74
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PRADC1-201ENST00000258083 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.25■■■■□ 3.71
PRADC1-201ENST00000258083 JPH4Q96JJ6 628 aa38.22■■■■□ 3.71
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