RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375227.8

LLGL2-202, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-202ENST00000375227 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.88■■■■■ 6.38
LLGL2-202ENST00000375227 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.95■■■■■ 5.43
LLGL2-202ENST00000375227 ABCC9O60706 1549 aa48.44■■■■■ 5.34
LLGL2-202ENST00000375227 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.29■■■■■ 5
LLGL2-202ENST00000375227 NACADO15069 1562 aa46.11■■■■■ 4.97
LLGL2-202ENST00000375227 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.04■■■■■ 4.96
LLGL2-202ENST00000375227 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.66■■■■■ 4.9
LLGL2-202ENST00000375227 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
LLGL2-202ENST00000375227 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.34■■■■■ 4.85
LLGL2-202ENST00000375227 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.32■■■■■ 4.85
LLGL2-202ENST00000375227 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.2■■■■■ 4.83
LLGL2-202ENST00000375227 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.01■■■■■ 4.8
LLGL2-202ENST00000375227 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.92■■■■■ 4.78
LLGL2-202ENST00000375227 SCRIBQ14160 1630 aa44.74■■■■■ 4.75
LLGL2-202ENST00000375227 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.33■■■■■ 4.69
LLGL2-202ENST00000375227 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
LLGL2-202ENST00000375227 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.77■■■■■ 4.6
LLGL2-202ENST00000375227 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.53■■■■■ 4.56
LLGL2-202ENST00000375227 SMARCA4P51532 1647 aa42.71■■■■■ 4.43
LLGL2-202ENST00000375227 NCAPD3P42695 1498 aa42.58■■■■■ 4.41
LLGL2-202ENST00000375227 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.58■■■■■ 4.41
LLGL2-202ENST00000375227 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
LLGL2-202ENST00000375227 SMARCA2P51531 1590 aa42.44■■■■■ 4.38
LLGL2-202ENST00000375227 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.35■■■■■ 4.37
LLGL2-202ENST00000375227 HMGXB3Q12766 1538 aa42.34■■■■■ 4.37
LLGL2-202ENST00000375227 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.25■■■■■ 4.35
LLGL2-202ENST00000375227 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
LLGL2-202ENST00000375227 WIZO95785 1651 aa41.88■■■■■ 4.29
LLGL2-202ENST00000375227 NESP48681 1621 aa41.82■■■■■ 4.29
LLGL2-202ENST00000375227 ERCC6Q03468 1493 aa41.72■■■■■ 4.27
LLGL2-202ENST00000375227 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
LLGL2-202ENST00000375227 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.52■■■■■ 4.24
LLGL2-202ENST00000375227 CUX2O14529 1486 aa41.41■■■■■ 4.22
LLGL2-202ENST00000375227 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
LLGL2-202ENST00000375227 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.32■■■■■ 4.2
LLGL2-202ENST00000375227 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.28■■■■■ 4.2
LLGL2-202ENST00000375227 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
LLGL2-202ENST00000375227 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.23■■■■■ 4.19
LLGL2-202ENST00000375227 CFTRP13569 1480 aa40.99■■■■■ 4.15
LLGL2-202ENST00000375227 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.89■■■■■ 4.14
LLGL2-202ENST00000375227 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.89■■■■■ 4.14
LLGL2-202ENST00000375227 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.88■■■■■ 4.13
LLGL2-202ENST00000375227 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.85■■■■■ 4.13
LLGL2-202ENST00000375227 WDR62O43379 1518 aa40.79■■■■■ 4.12
LLGL2-202ENST00000375227 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.68■■■■■ 4.1
LLGL2-202ENST00000375227 PRDM2Q13029 1718 aa40.64■■■■■ 4.1
LLGL2-202ENST00000375227 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
LLGL2-202ENST00000375227 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
LLGL2-202ENST00000375227 TOPBP1Q92547 1522 aa40.19■■■■■ 4.02
LLGL2-202ENST00000375227 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.08■■■■■ 4.01
LLGL2-202ENST00000375227 ABCC8Q09428 1581 aa40.02■■■■■ 4
LLGL2-202ENST00000375227 IFT140Q96RY7 1462 aa40■■■■□ 3.99
LLGL2-202ENST00000375227 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
LLGL2-202ENST00000375227 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
LLGL2-202ENST00000375227 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
LLGL2-202ENST00000375227 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
LLGL2-202ENST00000375227 CUX1P39880 1505 aa39.75■■■■□ 3.95
LLGL2-202ENST00000375227 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.7■■■■□ 3.95
LLGL2-202ENST00000375227 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.67■■■■□ 3.94
LLGL2-202ENST00000375227 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.65■■■■□ 3.943e-6■■□□□ 12.1
LLGL2-202ENST00000375227 SOGA1O94964 1423 aa39.61■■■■□ 3.93
LLGL2-202ENST00000375227 OSCARQ8IYS5 282 aa39.59■■■■□ 3.93
LLGL2-202ENST00000375227 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
LLGL2-202ENST00000375227 WDR97A6NE52 1622 aa39.38■■■■□ 3.89
LLGL2-202ENST00000375227 CHD1O14646 1710 aa39.34■■■■□ 3.89
LLGL2-202ENST00000375227 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.28■■■■□ 3.88
LLGL2-202ENST00000375227 SYNJ1O43426 1573 aa39.27■■■■□ 3.88
LLGL2-202ENST00000375227 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.27■■■■□ 3.88
LLGL2-202ENST00000375227 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.24■■■■□ 3.87
LLGL2-202ENST00000375227 TOP2BQ02880 1626 aa39.24■■■■□ 3.87
LLGL2-202ENST00000375227 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.23■■■■□ 3.87
LLGL2-202ENST00000375227 FBLN2P98095 1184 aa39.21■■■■□ 3.87
LLGL2-202ENST00000375227 TRIM41Q8WV44 630 aa39.21■■■■□ 3.87
LLGL2-202ENST00000375227 GRIN2BQ13224 1484 aa39.2■■■■□ 3.87
LLGL2-202ENST00000375227 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.15■■■■□ 3.86
LLGL2-202ENST00000375227 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.14■■■■□ 3.86
LLGL2-202ENST00000375227 PBRM1Q86U86 1689 aa39.13■■■■□ 3.85
LLGL2-202ENST00000375227 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
LLGL2-202ENST00000375227 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.11■■■■□ 3.85
LLGL2-202ENST00000375227 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.11■■■■□ 3.85
LLGL2-202ENST00000375227 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.11■■■■□ 3.85
LLGL2-202ENST00000375227 ARHGEF11O15085 1522 aa39.04■■■■□ 3.84
LLGL2-202ENST00000375227 SYNJ2O15056 1496 aa39■■■■□ 3.83
LLGL2-202ENST00000375227 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
LLGL2-202ENST00000375227 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.89■■■■□ 3.82
LLGL2-202ENST00000375227 ADAMTS12P58397 1594 aa38.82■■■■□ 3.8
LLGL2-202ENST00000375227 ARAP1Q96P48 1450 aa38.73■■■■□ 3.79
LLGL2-202ENST00000375227 GRIN2AQ12879 1464 aa38.72■■■■□ 3.79
LLGL2-202ENST00000375227 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.72■■■■□ 3.79
LLGL2-202ENST00000375227 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.68■■■■□ 3.78
LLGL2-202ENST00000375227 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.66■■■■□ 3.78
LLGL2-202ENST00000375227 CEP170Q5SW79 1584 aa38.6■■■■□ 3.77
LLGL2-202ENST00000375227 NUP160Q12769 1436 aa38.56■■■■□ 3.76
LLGL2-202ENST00000375227 KIF27Q86VH2 1401 aa38.45■■■■□ 3.75
LLGL2-202ENST00000375227 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.4■■■■□ 3.74
LLGL2-202ENST00000375227 IGF1RP08069 1367 aa38.39■■■■□ 3.74
LLGL2-202ENST00000375227 SHROOM2Q13796 1616 aa38.33■■■■□ 3.73
LLGL2-202ENST00000375227 CUL7Q14999 1698 aa38.28■■■■□ 3.72
LLGL2-202ENST00000375227 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.26■■■■□ 3.72
LLGL2-202ENST00000375227 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms