RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579522.1

AC005410.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC005410.1, Length 462 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005410.1-201ENST00000579522 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.62■■■■■ 6.01
AC005410.1-201ENST00000579522 ABCC9O60706 1549 aa48.73■■■■■ 5.39
AC005410.1-201ENST00000579522 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.62■■■■■ 5.21
AC005410.1-201ENST00000579522 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.63■■■■■ 5.06
AC005410.1-201ENST00000579522 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.88■■■■■ 4.94
AC005410.1-201ENST00000579522 NACADO15069 1562 aa45.31■■■■■ 4.84
AC005410.1-201ENST00000579522 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.23■■■■■ 4.83
AC005410.1-201ENST00000579522 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.96■■■■■ 4.79
AC005410.1-201ENST00000579522 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.76■■■■■ 4.76
AC005410.1-201ENST00000579522 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.56■■■■■ 4.72
AC005410.1-201ENST00000579522 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.32■■■■■ 4.69
AC005410.1-201ENST00000579522 CECR2Q9BXF3 1484 aa44■■■■■ 4.63
AC005410.1-201ENST00000579522 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.92■■■■■ 4.62
AC005410.1-201ENST00000579522 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.86■■■■■ 4.61
AC005410.1-201ENST00000579522 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
AC005410.1-201ENST00000579522 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.57■■■■■ 4.57
AC005410.1-201ENST00000579522 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
AC005410.1-201ENST00000579522 SCRIBQ14160 1630 aa43.39■■■■■ 4.54
AC005410.1-201ENST00000579522 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.38■■■■■ 4.53
AC005410.1-201ENST00000579522 CUX2O14529 1486 aa42.39■■■■■ 4.38
AC005410.1-201ENST00000579522 ERCC6Q03468 1493 aa42.16■■■■■ 4.34
AC005410.1-201ENST00000579522 NCAPD3P42695 1498 aa41.85■■■■■ 4.29
AC005410.1-201ENST00000579522 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.6■■■■■ 4.25
AC005410.1-201ENST00000579522 NESP48681 1621 aa41.55■■■■■ 4.24
AC005410.1-201ENST00000579522 HMGXB3Q12766 1538 aa41.44■■■■■ 4.22
AC005410.1-201ENST00000579522 SMARCA2P51531 1590 aa41.4■■■■■ 4.22
AC005410.1-201ENST00000579522 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
AC005410.1-201ENST00000579522 TRIM41Q8WV44 630 aa41.29■■■■■ 4.2
AC005410.1-201ENST00000579522 SMARCA4P51532 1647 aa41.26■■■■■ 4.2
AC005410.1-201ENST00000579522 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
AC005410.1-201ENST00000579522 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.07■■■■■ 4.16
AC005410.1-201ENST00000579522 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.93■■■■■ 4.14
AC005410.1-201ENST00000579522 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
AC005410.1-201ENST00000579522 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.9■■■■■ 4.14
AC005410.1-201ENST00000579522 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.85■■■■■ 4.13
AC005410.1-201ENST00000579522 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.6■■■■■ 4.09
AC005410.1-201ENST00000579522 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.55■■■■■ 4.08
AC005410.1-201ENST00000579522 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.55■■■■■ 4.08
AC005410.1-201ENST00000579522 WDR62O43379 1518 aa40.52■■■■■ 4.08
AC005410.1-201ENST00000579522 OSCARQ8IYS5 282 aa40.32■■■■■ 4.05
AC005410.1-201ENST00000579522 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.24■■■■■ 4.03
AC005410.1-201ENST00000579522 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.1■■■■■ 4.01
AC005410.1-201ENST00000579522 WIZO95785 1651 aa39.99■■■■□ 3.99
AC005410.1-201ENST00000579522 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.87■■■■□ 3.97
AC005410.1-201ENST00000579522 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.87■■■■□ 3.97
AC005410.1-201ENST00000579522 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.87■■■■□ 3.97
AC005410.1-201ENST00000579522 CFTRP13569 1480 aa39.86■■■■□ 3.97
AC005410.1-201ENST00000579522 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
AC005410.1-201ENST00000579522 ARHGEF11O15085 1522 aa39.65■■■■□ 3.94
AC005410.1-201ENST00000579522 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
AC005410.1-201ENST00000579522 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.47■■■■□ 3.91
AC005410.1-201ENST00000579522 IFT140Q96RY7 1462 aa39.46■■■■□ 3.91
AC005410.1-201ENST00000579522 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
AC005410.1-201ENST00000579522 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
AC005410.1-201ENST00000579522 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
AC005410.1-201ENST00000579522 PRDM2Q13029 1718 aa39.28■■■■□ 3.88
AC005410.1-201ENST00000579522 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
AC005410.1-201ENST00000579522 TOPBP1Q92547 1522 aa39.21■■■■□ 3.87
AC005410.1-201ENST00000579522 ARAP1Q96P48 1450 aa39.2■■■■□ 3.87
AC005410.1-201ENST00000579522 CHD1O14646 1710 aa39.09■■■■□ 3.85
AC005410.1-201ENST00000579522 ABCC8Q09428 1581 aa39.04■■■■□ 3.84
AC005410.1-201ENST00000579522 FBLN2P98095 1184 aa39.04■■■■□ 3.84
AC005410.1-201ENST00000579522 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.04■■■■□ 3.84
AC005410.1-201ENST00000579522 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.01■■■■□ 3.84
AC005410.1-201ENST00000579522 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
AC005410.1-201ENST00000579522 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.96■■■■□ 3.83
AC005410.1-201ENST00000579522 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
AC005410.1-201ENST00000579522 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
AC005410.1-201ENST00000579522 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.65■■■■□ 3.78
AC005410.1-201ENST00000579522 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
AC005410.1-201ENST00000579522 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.65■■■■□ 3.78
AC005410.1-201ENST00000579522 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.6■■■■□ 3.77
AC005410.1-201ENST00000579522 SOGA1O94964 1423 aa38.57■■■■□ 3.77
AC005410.1-201ENST00000579522 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
AC005410.1-201ENST00000579522 SYNJ1O43426 1573 aa38.55■■■■□ 3.76
AC005410.1-201ENST00000579522 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
AC005410.1-201ENST00000579522 WDR97A6NE52 1622 aa38.43■■■■□ 3.74
AC005410.1-201ENST00000579522 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.37■■■■□ 3.73
AC005410.1-201ENST00000579522 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.35■■■■□ 3.73
AC005410.1-201ENST00000579522 GRIN2BQ13224 1484 aa38.35■■■■□ 3.73
AC005410.1-201ENST00000579522 SYNJ2O15056 1496 aa38.34■■■■□ 3.73
AC005410.1-201ENST00000579522 CUX1P39880 1505 aa38.15■■■■□ 3.7
AC005410.1-201ENST00000579522 PBRM1Q86U86 1689 aa38.07■■■■□ 3.68
AC005410.1-201ENST00000579522 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.99■■■■□ 3.67
AC005410.1-201ENST00000579522 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.87■■■■□ 3.65
AC005410.1-201ENST00000579522 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.86■■■■□ 3.65
AC005410.1-201ENST00000579522 GRIN2AQ12879 1464 aa37.85■■■■□ 3.65
AC005410.1-201ENST00000579522 CEP170Q5SW79 1584 aa37.83■■■■□ 3.65
AC005410.1-201ENST00000579522 NUP160Q12769 1436 aa37.76■■■■□ 3.63
AC005410.1-201ENST00000579522 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.72■■■■□ 3.63
AC005410.1-201ENST00000579522 ADAMTS12P58397 1594 aa37.68■■■■□ 3.62
AC005410.1-201ENST00000579522 SHROOM2Q13796 1616 aa37.67■■■■□ 3.62
AC005410.1-201ENST00000579522 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.55■■■■□ 3.6
AC005410.1-201ENST00000579522 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.53■■■■□ 3.6
AC005410.1-201ENST00000579522 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.52■■■■□ 3.6
AC005410.1-201ENST00000579522 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
AC005410.1-201ENST00000579522 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.46■■■■□ 3.59
AC005410.1-201ENST00000579522 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.42■■■■□ 3.58
AC005410.1-201ENST00000579522 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.39■■■■□ 3.58
AC005410.1-201ENST00000579522 JPH4Q96JJ6 628 aa37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms