Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3CQ96E17 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3CQ96E17 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms