Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB3CQ96E17 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3CQ96E17 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB3CQ96E17 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3CQ96E17 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB3CQ96E17 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB3CQ96E17 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB3CQ96E17 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB3CQ96E17 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB3CQ96E17 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB3CQ96E17 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB3CQ96E17 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3CQ96E17 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3CQ96E17 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3CQ96E17 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB3CQ96E17 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB3CQ96E17 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3CQ96E17 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3CQ96E17 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3CQ96E17 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3CQ96E17 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3CQ96E17 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB3CQ96E17 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3CQ96E17 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3CQ96E17 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3CQ96E17 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3CQ96E17 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB3CQ96E17 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3CQ96E17 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3CQ96E17 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3CQ96E17 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3CQ96E17 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3CQ96E17 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3CQ96E17 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3CQ96E17 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3CQ96E17 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3CQ96E17 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3CQ96E17 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3CQ96E17 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3CQ96E17 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3CQ96E17 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3CQ96E17 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3CQ96E17 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3CQ96E17 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3CQ96E17 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3CQ96E17 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3CQ96E17 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB3CQ96E17 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB3CQ96E17 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB3CQ96E17 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB3CQ96E17 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3CQ96E17 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3CQ96E17 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3CQ96E17 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3CQ96E17 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3CQ96E17 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3CQ96E17 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3CQ96E17 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3CQ96E17 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3CQ96E17 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3CQ96E17 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3CQ96E17 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3CQ96E17 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3CQ96E17 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3CQ96E17 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3CQ96E17 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3CQ96E17 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3CQ96E17 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3CQ96E17 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3CQ96E17 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3CQ96E17 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3CQ96E17 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3CQ96E17 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3CQ96E17 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3CQ96E17 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3CQ96E17 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3CQ96E17 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3CQ96E17 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3CQ96E17 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3CQ96E17 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3CQ96E17 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3CQ96E17 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3CQ96E17 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3CQ96E17 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3CQ96E17 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3CQ96E17 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3CQ96E17 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3CQ96E17 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3CQ96E17 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3CQ96E17 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3CQ96E17 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3CQ96E17 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB3CQ96E17 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3CQ96E17 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3CQ96E17 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3CQ96E17 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3CQ96E17 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3CQ96E17 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3CQ96E17 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3CQ96E17 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms