Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGCS1Q01581 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms