Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN2DP55273 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2DP55273 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms