Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC1P48547 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC1P48547 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC1P48547 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms