Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMBRP28336 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMBRP28336 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMBRP28336 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMBRP28336 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMBRP28336 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBRP28336 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBRP28336 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBRP28336 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBRP28336 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBRP28336 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBRP28336 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NMBRP28336 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NMBRP28336 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NMBRP28336 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMBRP28336 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMBRP28336 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMBRP28336 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMBRP28336 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMBRP28336 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMBRP28336 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMBRP28336 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMBRP28336 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBRP28336 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBRP28336 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBRP28336 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBRP28336 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBRP28336 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBRP28336 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBRP28336 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBRP28336 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMBRP28336 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMBRP28336 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMBRP28336 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMBRP28336 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMBRP28336 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMBRP28336 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMBRP28336 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMBRP28336 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBRP28336 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBRP28336 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMBRP28336 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMBRP28336 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMBRP28336 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NMBRP28336 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMBRP28336 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMBRP28336 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMBRP28336 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMBRP28336 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMBRP28336 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMBRP28336 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMBRP28336 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMBRP28336 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMBRP28336 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMBRP28336 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMBRP28336 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMBRP28336 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NMBRP28336 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMBRP28336 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMBRP28336 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMBRP28336 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMBRP28336 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMBRP28336 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMBRP28336 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMBRP28336 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMBRP28336 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMBRP28336 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NMBRP28336 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMBRP28336 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMBRP28336 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMBRP28336 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMBRP28336 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMBRP28336 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMBRP28336 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMBRP28336 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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