Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NMBRP28336 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NMBRP28336 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NMBRP28336 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NMBRP28336 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NMBRP28336 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NMBRP28336 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NMBRP28336 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
NMBRP28336 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NMBRP28336 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NMBRP28336 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NMBRP28336 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NMBRP28336 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NMBRP28336 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NMBRP28336 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NMBRP28336 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NMBRP28336 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NMBRP28336 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NMBRP28336 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NMBRP28336 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NMBRP28336 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NMBRP28336 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NMBRP28336 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NMBRP28336 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NMBRP28336 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NMBRP28336 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NMBRP28336 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NMBRP28336 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NMBRP28336 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NMBRP28336 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NMBRP28336 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NMBRP28336 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NMBRP28336 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NMBRP28336 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NMBRP28336 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NMBRP28336 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NMBRP28336 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NMBRP28336 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NMBRP28336 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NMBRP28336 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NMBRP28336 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NMBRP28336 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NMBRP28336 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NMBRP28336 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NMBRP28336 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NMBRP28336 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NMBRP28336 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NMBRP28336 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NMBRP28336 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NMBRP28336 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NMBRP28336 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NMBRP28336 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NMBRP28336 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NMBRP28336 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NMBRP28336 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NMBRP28336 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NMBRP28336 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NMBRP28336 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NMBRP28336 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NMBRP28336 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NMBRP28336 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NMBRP28336 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NMBRP28336 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NMBRP28336 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NMBRP28336 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NMBRP28336 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NMBRP28336 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NMBRP28336 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NMBRP28336 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NMBRP28336 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NMBRP28336 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NMBRP28336 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NMBRP28336 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NMBRP28336 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NMBRP28336 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NMBRP28336 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NMBRP28336 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NMBRP28336 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NMBRP28336 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NMBRP28336 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NMBRP28336 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NMBRP28336 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NMBRP28336 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NMBRP28336 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NMBRP28336 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NMBRP28336 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NMBRP28336 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NMBRP28336 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NMBRP28336 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NMBRP28336 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NMBRP28336 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NMBRP28336 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NMBRP28336 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NMBRP28336 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NMBRP28336 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NMBRP28336 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NMBRP28336 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NMBRP28336 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NMBRP28336 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NMBRP28336 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
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