Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC4LP0CB38 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC4LP0CB38 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC4LP0CB38 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC4LP0CB38 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC4LP0CB38 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC4LP0CB38 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC4LP0CB38 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PABPC4LP0CB38 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC4LP0CB38 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms