Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms