Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC25A20O43772 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A20O43772 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A20O43772 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A20O43772 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A20O43772 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A20O43772 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A20O43772 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A20O43772 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A20O43772 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A20O43772 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A20O43772 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A20O43772 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A20O43772 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A20O43772 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A20O43772 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A20O43772 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC25A20O43772 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC25A20O43772 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A20O43772 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A20O43772 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A20O43772 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC25A20O43772 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC25A20O43772 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC25A20O43772 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC25A20O43772 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A20O43772 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A20O43772 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC25A20O43772 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A20O43772 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC25A20O43772 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC25A20O43772 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC25A20O43772 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC25A20O43772 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC25A20O43772 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A20O43772 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A20O43772 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A20O43772 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A20O43772 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A20O43772 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC25A20O43772 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC25A20O43772 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A20O43772 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A20O43772 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A20O43772 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A20O43772 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A20O43772 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A20O43772 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A20O43772 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A20O43772 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A20O43772 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A20O43772 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A20O43772 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A20O43772 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A20O43772 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC25A20O43772 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A20O43772 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A20O43772 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A20O43772 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A20O43772 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A20O43772 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A20O43772 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A20O43772 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A20O43772 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A20O43772 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A20O43772 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A20O43772 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC25A20O43772 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A20O43772 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC25A20O43772 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC25A20O43772 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC25A20O43772 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC25A20O43772 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC25A20O43772 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A20O43772 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A20O43772 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A20O43772 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A20O43772 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC25A20O43772 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC25A20O43772 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC25A20O43772 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC25A20O43772 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC25A20O43772 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC25A20O43772 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC25A20O43772 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC25A20O43772 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC25A20O43772 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC25A20O43772 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC25A20O43772 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC25A20O43772 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A20O43772 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A20O43772 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC25A20O43772 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A20O43772 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A20O43772 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A20O43772 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A20O43772 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A20O43772 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A20O43772 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A20O43772 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms