Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms