RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.14■■■■□ 3.7
PACS1-209ENST00000529757 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.39■■■□□ 2.94
PACS1-209ENST00000529757 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
PACS1-209ENST00000529757 ABCC9O60706 1549 aa31.7■■■□□ 2.67
PACS1-209ENST00000529757 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.57■■■□□ 2.64
PACS1-209ENST00000529757 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.51■■■□□ 2.64
PACS1-209ENST00000529757 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.27■■■□□ 2.6
PACS1-209ENST00000529757 NACADO15069 1562 aa31.14■■■□□ 2.58
PACS1-209ENST00000529757 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.92■■■□□ 2.54
PACS1-209ENST00000529757 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.92■■■□□ 2.54
PACS1-209ENST00000529757 SCRIBQ14160 1630 aa30.63■■■□□ 2.49
PACS1-209ENST00000529757 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.23■■■□□ 2.43
PACS1-209ENST00000529757 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.96■■■□□ 2.39
PACS1-209ENST00000529757 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
PACS1-209ENST00000529757 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
PACS1-209ENST00000529757 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
PACS1-209ENST00000529757 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PACS1-209ENST00000529757 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PACS1-209ENST00000529757 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.44■■■□□ 2.3
PACS1-209ENST00000529757 SMARCA4P51532 1647 aa29.37■■■□□ 2.29
PACS1-209ENST00000529757 WIZO95785 1651 aa29.18■■■□□ 2.26
PACS1-209ENST00000529757 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PACS1-209ENST00000529757 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.03■■■□□ 2.24
PACS1-209ENST00000529757 SMARCA2P51531 1590 aa28.94■■■□□ 2.22
PACS1-209ENST00000529757 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.93■■■□□ 2.22
PACS1-209ENST00000529757 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PACS1-209ENST00000529757 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PACS1-209ENST00000529757 NCAPD3P42695 1498 aa28.73■■■□□ 2.19
PACS1-209ENST00000529757 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.7■■■□□ 2.18
PACS1-209ENST00000529757 HMGXB3Q12766 1538 aa28.69■■■□□ 2.18
PACS1-209ENST00000529757 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.59■■■□□ 2.17
PACS1-209ENST00000529757 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.29■■■□□ 2.12
PACS1-209ENST00000529757 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.1■■■□□ 2.09
PACS1-209ENST00000529757 CFTRP13569 1480 aa28.03■■■□□ 2.08
PACS1-209ENST00000529757 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.97■■■□□ 2.07
PACS1-209ENST00000529757 TRIM41Q8WV44 630 aa27.92■■■□□ 2.06
PACS1-209ENST00000529757 ABCC8Q09428 1581 aa27.91■■■□□ 2.06
PACS1-209ENST00000529757 PRDM2Q13029 1718 aa27.87■■■□□ 2.05
PACS1-209ENST00000529757 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.8■■■□□ 2.04
PACS1-209ENST00000529757 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
PACS1-209ENST00000529757 NESP48681 1621 aa27.76■■■□□ 2.03
PACS1-209ENST00000529757 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.66■■■□□ 2.02
PACS1-209ENST00000529757 SYNJ1O43426 1573 aa27.66■■■□□ 2.02
PACS1-209ENST00000529757 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.59■■■□□ 2.01
PACS1-209ENST00000529757 TOP2BQ02880 1626 aa27.59■■■□□ 2.01
PACS1-209ENST00000529757 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.56■■■□□ 2
PACS1-209ENST00000529757 CUX1P39880 1505 aa27.56■■■□□ 2
PACS1-209ENST00000529757 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.52■■■□□ 2
PACS1-209ENST00000529757 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.44■■□□□ 1.98
PACS1-209ENST00000529757 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.39■■□□□ 1.98
PACS1-209ENST00000529757 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PACS1-209ENST00000529757 SOGA1O94964 1423 aa27.34■■□□□ 1.97
PACS1-209ENST00000529757 TOPBP1Q92547 1522 aa27.34■■□□□ 1.97
PACS1-209ENST00000529757 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PACS1-209ENST00000529757 EEA1Q15075 1411 aa27.3■■□□□ 1.96
PACS1-209ENST00000529757 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.29■■□□□ 1.96
PACS1-209ENST00000529757 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.24■■□□□ 1.95
PACS1-209ENST00000529757 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.24■■□□□ 1.95
PACS1-209ENST00000529757 ERCC6Q03468 1493 aa27.23■■□□□ 1.95
PACS1-209ENST00000529757 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PACS1-209ENST00000529757 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.17■■□□□ 1.94
PACS1-209ENST00000529757 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.14■■□□□ 1.93
PACS1-209ENST00000529757 KIF27Q86VH2 1401 aa27.11■■□□□ 1.93
PACS1-209ENST00000529757 WDR62O43379 1518 aa27.1■■□□□ 1.93
PACS1-209ENST00000529757 CUX2O14529 1486 aa27.08■■□□□ 1.92
PACS1-209ENST00000529757 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.08■■□□□ 1.92
PACS1-209ENST00000529757 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PACS1-209ENST00000529757 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.05■■□□□ 1.92
PACS1-209ENST00000529757 WDR97A6NE52 1622 aa26.98■■□□□ 1.91
PACS1-209ENST00000529757 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.96■■□□□ 1.91
PACS1-209ENST00000529757 KIF21BO75037 1637 aa26.95■■□□□ 1.9
PACS1-209ENST00000529757 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PACS1-209ENST00000529757 GOLGA3Q08378 1498 aa26.9■■□□□ 1.9
PACS1-209ENST00000529757 IFT140Q96RY7 1462 aa26.88■■□□□ 1.89
PACS1-209ENST00000529757 PRXQ9BXM0 1461 aa26.87■■□□□ 1.89
PACS1-209ENST00000529757 IGF1RP08069 1367 aa26.86■■□□□ 1.89
PACS1-209ENST00000529757 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.85■■□□□ 1.89
PACS1-209ENST00000529757 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PACS1-209ENST00000529757 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.82■■□□□ 1.88
PACS1-209ENST00000529757 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.81■■□□□ 1.88
PACS1-209ENST00000529757 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.81■■□□□ 1.88
PACS1-209ENST00000529757 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.77■■□□□ 1.88
PACS1-209ENST00000529757 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PACS1-209ENST00000529757 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.74■■□□□ 1.87
PACS1-209ENST00000529757 CUL7Q14999 1698 aa26.71■■□□□ 1.87
PACS1-209ENST00000529757 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
PACS1-209ENST00000529757 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.867e-7■■■■□ 23.3
PACS1-209ENST00000529757 PBRM1Q86U86 1689 aa26.66■■□□□ 1.86
PACS1-209ENST00000529757 GRIN2BQ13224 1484 aa26.64■■□□□ 1.85
PACS1-209ENST00000529757 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PACS1-209ENST00000529757 CEP162Q5TB80 1403 aa26.61■■□□□ 1.85
PACS1-209ENST00000529757 ADAMTS12P58397 1594 aa26.52■■□□□ 1.84
PACS1-209ENST00000529757 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.52■■□□□ 1.84
PACS1-209ENST00000529757 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.47■■□□□ 1.83
PACS1-209ENST00000529757 CLIP1P30622 1438 aa26.46■■□□□ 1.83
PACS1-209ENST00000529757 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PACS1-209ENST00000529757 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.37■■□□□ 1.81
PACS1-209ENST00000529757 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PACS1-209ENST00000529757 SYNJ2O15056 1496 aa26.33■■□□□ 1.81
PACS1-209ENST00000529757 GRIN2AQ12879 1464 aa26.31■■□□□ 1.8
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